近日,江漢大學生命科學學院師生在國際著名期刊《BMC生物學》(《BMC Biology》,中科院SCI一區,TOP期刊)在線發表研究論文。江漢大學為第一完成單位,王瑩副教授和2021級碩士研究生張雪晶為論文共同第一作者。
鯉科是魚類中種類最多的一個科,它們展現出對不同的水生環境獨有的適應性,但是在海水中生存是非常罕見的。珠星三塊魚和灘頭三塊魚是中國目前已知的鯉科中唯一溯河洄游的魚類。因此,它們為鯉科魚類適應海水的遺傳基礎研究提供了理想模型。
該研究完成了珠星三塊魚和灘頭三塊魚的染色體水平全基因組組裝和分析。通過與其近緣16種淡水硬骨魚進行比較基因組學分析,發現珠星三塊魚和灘頭三塊魚發生許多與海水適應相關的特異性遺傳變異,篩選出與海水適應相關的9個正選擇基因和7個快速進化基因,其中包括滲透壓調節基因(slc2a3、cldn10、prl等)和視覺基因(rh1),以及特異的保守非編碼元件。功能實驗驗證發現三塊魚特有的遺傳變異對其適應海水環境發揮了重要作用。
此項研究得到中國科學院水生生物研究所何舜平研究員及其團隊的指導和幫助,并受到國家自然科學基金和江漢大學校級科研項目(科技類專項)的資助支持。(文:生命科學學院 編輯:趙明)
論文原文鏈接:
Genomic insights into the seawater adaptation in Cyprinidae
https://bmcbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12915-024-01885-2