汽車工程系，前身是甘肅省交通學校汽修科，創辦于1979年，2003年學院升格后成立汽筑工程系，2021年學院機構改革，汽筑工程系分為汽車工程系和機電工程系兩個系部。2003年被教育部、交通部等六部委確定為甘肅省唯一承擔全國汽車運用維修專業領域技能型緊缺人才培養的院校，2008年被甘肅省職成協會聘為全省高職高專汽車運用與維修專業組組長單位，2014年加入中國汽車維修行業協會，2017年加入全國汽車服務職業教育集團并擔任集團常務理事，2017年獲批國家第二批現代學徒制試點專業單位，2019年獲批國家級汽車維修技術協同創新中心，2020年被評為新時代甘肅省高等院校黨建“標桿院系”，2021年被評為甘肅省省級標準化先進黨支部，2021年建成上汽大眾SCEP甘肅培訓基地，2022年被確定為中德先進職業教育合作項目首批試點院?！嚕ㄐ履茉矗╊I域。
汽車工程系開設汽車檢測與維修技術、汽車制造與試驗技術、新能源汽車檢測與維修技術、智能網聯汽車技術4個專業，現有在校生1435人，教職工37人，其中，教授5人、副教授8人，博士、碩士研究生學歷12人，“雙師型”教師20人，交通運輸部學科帶頭人1人，省級教學名師2人，省級“教學園丁獎”獲得者2人，省級“青年教師成才獎”獲得者1人，省級技術標兵1人、全省優秀黨務工作者1人、全省高校科研、黨建雙帶頭人1人、國家級大賽裁判5人。
汽車工程系擁有上汽大眾SCEP甘肅培訓基地、中德陸克思德實訓中心、傳統汽車檢測與維修技術實訓中心、新能源汽車檢測與維修實訓中心、現代學徒制汽車制造與裝配實訓中心、汽車車身修復與噴涂實訓中心、汽車營銷與商務實訓中心、智慧交通與智能汽車體驗中心等20多個校內專業實訓室，建筑面積12000平方米，設備總值7000余萬元。
汽車工程系與上汽大眾集團、新疆廣匯集團甘肅公司、江鈴汽車、吉利汽車、奇瑞汽車、北汽新能源汽車、國內奔馳、寶馬、奧迪品牌4S店等20多家企業建立了穩定的校企合作關系，2013年與中德諾浩教育集團合作開辦了基于德國“雙元制”教育模式的“中德諾浩汽車技師班”。
汽車工程系近年來承辦了全省職業院校技能大賽高職組新能源汽車技術與服務比賽1次、中職組汽車營銷與服務接待比賽1次、中職組新能源汽車檢測與維修比賽1次。師生參加全國和省級比賽取得了優異成績，其中教師獲全國高職類教學比賽三等獎1項、全省高職類教學比賽一等獎2項、二等獎2項、三等獎2項；學生參加全國職業院校技能大賽獲二等獎3項、三等獎3項；獲省級技能大賽一等獎3項、二等獎6項、三等獎7項。
汽車工程系堅持“立德樹人、厚基強能、創新育匠”特色人才培養，致力為黨育才、為國育人，著力培養能工巧匠、大國工匠，自成立以來為汽車行業培養了10000余名優秀人才，近年來畢業生就業率均在98%以上。
