廈門醫學院圖書館實行“藏、借、閱、習”一體化管理模式。圖書館館舍面積12700平方米，閱覽座位1200席。館藏總量為117.1萬冊，其中紙質圖書57.6萬冊，電子圖書59.5萬冊，現有紙質期刊619種，報紙40種。引進和購置中、外文數據庫22個，有4300種隨書光盤可以在線瀏覽使用。周一至周日全天開放，周開放時間達105小時，電子資源24小時開放。館內設有：綜合圖書閱覽室、醫學圖書閱覽室、報刊閱覽室、教師研究室、中文期刊過刊閱覽室、電子閱覽室，電子閱覽室擁有120個機座，可向師生提供網絡、光盤等電子信息的檢索和咨詢服務。館內一卡通的使用，集入館、借書、預約于一體;已經實現全開放、大流通、多自助的先進管理模式。為師生提供了最快捷、全方位的信息獲取與交流的平臺。
館藏資源建設圍繞著學院的專業設置及教學科研需要，以醫藥衛生類學科書刊為特色。目前，圖書館已基本形成印刷型文獻與電子文獻并存，實體資源與虛擬資源有機結合，以臨床醫學、口腔醫學、護理學、藥學等專業為主，涵蓋全校各學科專業，基本滿足我院教學和學習需要的藏書體系。
圖書館于2002年3月開始啟用圖書館自動化管理集成系統，目前已實現了書刊采訪、編目、典藏、流通、書目檢索等業務流程的計算機自動化管理，規范化、標準化的館藏書目數據庫也初步建立。局域網經過結構化布線，采用先進的網絡設施、服務器，可以與校園網、中國教育網和Internet相聯接。同時讀者在校園網內可進入圖書館網頁進行書目查詢、圖書續借等自助服務。
我館將堅持“讀者第一，服務育人”的辦館方向，以為教學、臨床、科研服務為宗旨，圍繞學院總體發展目標，繼續加強圖書館自動化、數字化建設。努力建設成為服務主導型的現代化專業性圖書館，以高質量、高效率為學校的教學科研和讀者服務。
