福建中醫藥大學中醫藥文化博物館坐落在風景如畫的福建中醫藥大學旗山校區。2013年，中醫藥文化博物館新館大樓落成，建筑面積9976平方米的，2016年9 月新館第一期裝修布展完成，對外開放（試運行）。
福建中醫藥大學博物館是我省第一個以展示中醫藥文化、閩臺醫藥文化及學校成就與發展史為主要內容的專題性博物館。由醫史館（閩臺醫藥文化展區）、人體生命科學館、康復醫學館、中藥標本館、校史館等展館以及“時珍園”藥用植物園組成。其中，展館展陳面積6650平方米，“時珍園”藥用植物園面積100多畝。新館一期展館目前設有醫史館、人體生命科學館、校史館及閩怡園展區?，F有館藏醫史文物展品1000余件，其中，藏醫手術器械、仿北宋天圣銅人、清代中藥榨汁機、清代婦科診斷模型、清代串鈴等藏品均為珍貴醫史文物，著名畫家張英等社會名流為我校創作的字畫等也是十分寶貴的展品。圖片8000余幅，各種動植物標本、礦物標本、中藥飲片、中成藥等3000余件。
博物館展示了中醫藥學從形成到繁榮、從繼承到創新的軌跡，是博大精深的中醫藥學和中醫藥文化的縮影，是學校中醫藥文化建設的重要組成部分，集教學、科普、觀光等功能于一體，已成為福建省社會科學普及教育基地、福州市科普教育基地，是學校中醫藥文化傳播、中醫藥文化知識普及、交流的重要窗口。新館開放以來，已接待的海內外各界人士、中小學生等參觀人數約3000余人次。
