食品科學系是甘肅畜牧工程職業技術學院開設的新型特色系之一，成立于2005年6月。建系以來，在學院的關心和領導下，經全系師生的共同努力，通過調整、擴大、發展和提高，全系學科建設、師資隊伍已得到迅速發展，科研和技術推廣能力不斷提升，專業人才隊伍和管理隊伍已初具規?！，F開設有食品加工技術專業、食品營養與檢測專業、食品生物技術專業、釀酒技術（葡萄與葡萄酒工程方向）、農產品加工與質量檢測專業和園藝技術專業。全系在校學生1200多人。
建系以來，全系教師銳意進取，堅持以思想為保證，團結為動力，發展為核心的工作思路，以提高教學質量為核心，以師資隊伍建設和專業建設為重點，以培養技術技能人才為己任，強化教學管理，深化教學改革，全面提高教學質量。食品科學系擁有一支結構合理、業務能力強、富有敬業精神和團隊意識的教師隊伍，現有教職工33人，其中教授2人，副教授4人，講師12人，碩士研究生9人，在讀碩士5人，同時聘請客座教授5人。主編或參編國家高職高專規劃教材及各類培訓教材30余部，主持或參與完成12項省、市及院列科研項目，并獲得“甘肅省科技進步獎”二等獎1項，農業部“農牧漁業豐收獎”三等獎1項，“甘肅省農牧漁業豐收獎”二等獎2項，“武威市科技進步獎”一等獎2項，申報專利6項，在各類期刊發表科技論文120余篇。
為滿足教學需要，食品科學系非常重視實驗室和實習基地建設，現有食品加工實訓室、食品微生物實訓室、食品分析與檢測實訓室、食品營養實訓室、乳品飲料加工中心、食品工程仿真實訓室、葡萄酒工藝實訓室、食品發酵實訓、軟飲料加工實訓室等專業實訓室16個及葡萄與葡萄酒工程研發中心和武威市葡萄與葡萄酒產業生產力促進中心及甘肅省中小企業公共服務平臺網絡葡萄與葡萄酒產業“窗口”平臺，教學設備先進，設施優良，開設有以企業命名的“威龍班”、“頂益班”等，并與山東威龍葡萄酒股份有限公司、達利集團甘肅食品公司、南京旺旺、南京喜之郎、南京雨潤集團、上海佳格、福建安井食品、杭州頂益（康師傅）食品等20多家國內大型食品企業建立了良好的頂崗實習和就業基地。
食品科學系在建設與發展過程中，秉承“自強 明德 尚能 篤行”的校訓，弘揚“團結創新，奮發有為”的精神，形成了“厚德博學、教書育人、勤學善思、學以致用”的優良系風。食品科學系堅持以立德樹人為根本，以服務發展為宗旨，以促進就業為導向，培養具有德、智、體、美、勞全面發展，實踐及創新創業能力強、專業素質高，掌握食品科學與工程、葡萄與葡萄酒工程、園藝技術、農產品加工與質量檢測的基本理論和基本技能的技術技能人才。
