建筑工程系成立于2004年4月,溯源自1958年成立的福建地質學校（1995年更名福建工程學校）,至今已有六十余年辦學歷史。近年來，堅持“厚德強能”教育教學理念，以“善建勤工”為系訓，傳承地質精神，不斷探索人才培養的新模式、新路徑，探索校企合作辦學的新機制，整體辦學水平和社會影響力不斷提升，建設特色鮮明的建工專業群不斷取得進展，建設中的測繪地理信息專業群也漸顯成效。近三年來，我系學生在國家級、省級各類職業技能競賽中屢創佳績，共獲國家級一等獎1個、二等獎7個、三等獎2人，獲省級一等獎4個、二等獎8個、三等獎4人。在2017年全國職業院校信息化教學大賽中，我系教師榮獲高職組信息化教學設計比賽一等獎，實現我省在該賽項上零的突破。
建筑工程系現開設建筑工程技術、工程造價、建筑裝飾工程技術、地籍測繪與土地管理與攝影測量與遙感技術（無人機方向）等5個專業，其中建筑工程技術是國家骨干院校重點建設專業，攝影測量與遙感技術（無人機方向）為2019年新增專業。同時，對接信息技術在建工、測繪地理信息領域的應用，規劃在2020年申辦建設項目信息化管理（BIM）、導航與位置服務專業。目前在校生1285人。
校內現擁有實驗實訓場地面達 5000多平方米，設備總價值1230多萬元。校內實訓基地引入企業工作環境，建有18個省內領先的專業實訓室，13個學生專業實踐工作室，2019年新建1：1等比例建筑模型樓及建筑信息化BIM理實一體實訓室，提供虛實一體的信息化教學實訓中心，為學生提供了良好的成才環境。同時，與福建地礦建設集團、廈門中誠建建筑勞務有限公司、泉州聯審工程造價咨詢有限公司、福建省晨曦信息科技股份有限公司、福建地質測繪院、福建省碩威工程科技股份有限公司、福州市勘測設計院等50多家企業共建校外實訓基地。
建筑工程系現有教職工52人，其中專業教師41人，副高職稱20人，具有碩士學位的教職工27人,絕大部分教師有企業實踐工作經歷,具備“雙師”素質。同時擁有特聘教授1人，并另聘請了50余名具有豐富理論基礎和實踐經驗的專家、高級工程師為客座教授、兼職教師。
建筑工程系注重學生學歷與能力提升，集美大學在學校設立專本銜接教學點，面向我系在校生招收工程管理專業專本銜接學生。在校期間，學生同步進行本科課程學習，專本銜接課程全部考試合格且獲得?？飘厴I證書，半年后可申請集美大學頒發的大學本科畢業證書。學生還可在通過學位英語考試后，按照集美大學本科學位管理委員會的規定獲得學士學位證書，國家承認其本科學歷和學士學位。
建筑工程系堅持以“產教融合”為核心，構建多元協同育人新模式；以“工匠精神”為核心，推動教育教學改革；以“立德樹人”為核心，探索校園品牌文化建設，努力為社會培養更多能吃苦、善溝通、懂技術的高素質技術技能人才。
