農業經濟管理系是浙江農業商貿職業學院的特色建設系，2015年，農業經濟管理系緊緊圍繞學院“以農為本、以商為重”，省內一流、系統領先、特色鮮明的高職院校的辦學定位，以迎接教育部人才培養工作評估 “回頭看”檢查和建設全國供銷合作總社示范高職院校為中心，以提高人才培養質量為關鍵，以塑造學生“三農”情懷為抓手，深化教育教學改革，重點加強實踐教學體系、課程和師資隊伍等的建設，深化校企合作機制，促進內涵發展，確保高質量通過，進一步提升了全系的綜合能力。
農業經濟管理系設有合作社經營管理教研室、電子商務教研室、綠色食品生產與經營教研室、合作社教育研究中心和學院“三農”問題研究中心等教學研究機構。紹興市大學生電子商務競賽基地、紹興市“三農”問題研究中心掛靠農業經濟管理系。
農業經濟管理系現有合作社經營管理、電子商務、綠色食品生產與經營和茶葉生產加工技術等4個高職專業，其中，合作社經營管理為中央財政重點支持專業。2015年申報茶藝與茶葉營銷專業。農業經濟管理系擁有省市級精品課程5門，其中，《農產品經紀人》為全國供銷總社精品課程、《管理實務》為省級精品課程、《合作社經濟》為紹興市精品課程、《電子商務概論》為院級精品課程。
農業經濟管理系現有教師35人，其中教授1人、副教授5人、講師7人，博士學位教師1人、碩士學位教師17人、在讀博士1人，是一支結構合理、業務強、教學水平高的師資隊伍。
農業經濟管理系建有合作社綜合實訓室、合作社經營沙盤、農產品營銷實驗室、電子商務綜合實訓室、綠色食品生產與檢測綜合實訓室、茶藝實訓室、茶葉加工實訓室等7個校內實訓基地，以及豐島集團等18家校外實習基地。
