水沙科學教育部重點實驗室成立于2000年8月。實驗室以理工結合為特色，將基礎與應用研究相結合，著眼國際前沿，服務社會經濟發展。研究方向包括（1）水沙運動及其地表過程；（2）水沙災害及其防治；（3）水沙運動及其環境效應；（4）水體污染治理與系統修復。實驗室研究具有鮮明的水沙科學與環境科學交叉的特點。結合國家重大科技項目和重要工程設計項目，初步建立了泥沙災害學的理論體系，研發了多項先進的水處理技術，并建立了國家認證認可的環境工程實驗室，水處理與環境微生物中試基地，以及旨在促進污水深度處理新型技術產業化的工程中心。目前，實驗室在水沙運動與水沙災害、環境微生物、城鎮污水處理、特種廢水處理、水資源管理、流域水沙環境與河流生態恢復、固體廢棄物處理等領域開展了大量的研究工作，不少專利成果已在重要的示范工程中得到成功的應用，產生了顯著的社會經濟和生態環境效益。
實驗室現有固定人員23人，包括國家杰出青年基金獲得者、教育部新世紀人才、百人計劃特聘研究員、北京市科技新星等。迄今為止，正在培養的博士生和碩士生達100余名。近5年，承擔了國家水體污染控制與治理科技重大專項項目、國家科技支撐計劃課題、國家863計劃課題、國家973計劃課題、重點項目等80多項。在“Environmental Science and Technology”、“Water Research”等國際著名期刊上發表SCI論文200多篇，出版專著5部，獲得授權專利40多項。有關成果獲得了國家科技進步二等獎、高等學校自然科學一等獎、高等學?？萍歼M步一等獎、北京市發明專利獎等十余項獎勵。
