佳木斯大學藥學化學實驗中心隸屬于黑龍江省教育廳，實行校、院二級管理體制。
佳木斯大學化學與藥學院由原佳木斯醫學院藥學系、佳木斯師范學院化學系、佳木斯工學院基礎化學部三所歷史悠久院校的系、部于1999年8月合并而成。學院成立后，
為了進一步加強實驗教學管理，提高實驗教學質量，增強學生的實踐能力和創新能力，全面整合學院的實驗教學資源和人力資源，充分發揮各類實驗室和實驗設備的功能，完善和調配實驗室的架構，本著“集中建設、統一管理、資源共享、優勢互補”的原則，于2003年4月，經佳木斯大學批準，成立了化學與藥學院實驗中心。通過幾年的實驗教學探索、實踐，充分體現出實驗中心的建立，極大地促進了實驗室的標準化建設，在教學環境、設施和條件、管理、后勤保障等諸多方面得到了很大的提高和完善。根據大學發展建設的需要，于2005年4月經佳木斯大學批準，更名為“藥學化學實驗中心”，現面向全校理、工、醫11個學院25個專業的實驗教學工作，對不同學院、不同專業的80個教學班2383人，分別開設共計214個實驗項目，每年平均承擔24萬人時數的實驗教學任務。實驗中心下設藥學、專業化學和基礎化學三大實驗室，儀器設備總值達766萬元，共計2309臺件，建有各類功能實驗室51個，其它實驗用房22個，總面積為5390m2，其中藥學實驗室設有藥劑學、藥物分析、天然藥物化學、藥物化學、藥物合成、生藥學和制藥工程七個學科實驗室；專業化學實驗室設有無機化學、有機化學、分析化學、物理化學、中學教學法和化工原理六個學科實驗室；基礎化學實驗室設有無機化學、有機化學、分析化學、物理化學和工程化學5個學科實驗室?；A化學實驗室現是佳木斯大學校級重點實驗室，于2004年7月被黑龍江省教育廳評為全國普通高等院?；A課實驗室評估合格單位。2005年，在化學與藥學院實驗中心的基礎上，建成了生物藥物制劑省級重點實驗室。
