吉林大學人獸共患病研究教育部重點實驗室是我國首家從事人獸共患病研究的專職研究機構和國家首批人獸共患疫病學博士點單位。研究團隊為2007年度教育部創新團隊。
為及時應對人獸共患病肆虐的嚴峻形勢，吉林大學整合了農學部、醫學部等相關學科資源于2006年1月成立了世界上首家人獸共患病專職研究所—吉林大學人獸共患病研究所，并于2006年6月籌建人獸共患病研究教育部重點實驗室，2007年通過驗收。2009年8月與中國醫學科學院病原生物學研究所共建人獸共患病研究中心。
自成立以來研究所與重點實驗室科研人員充分發揮自身所具有的醫學和獸醫學學科交叉優勢，逐步形成了以人獸共患病病原檢測、流行病學調查、藥物靶標篩選、致病機理等為突出特色的研究方向。特別在高致病性禽流感、甲型流感病毒、狂犬病、結核桿菌病、布魯氏菌病、蜱傳疾病及動物源性食品重要人獸共患病病原（如旋毛蟲、華支睪吸蟲、隱孢子蟲、血吸蟲、弓形蟲）、動物性食品衛生與安全等方面開展了廣泛與深入的研究，部分研究成果居國際前沿水平。
研究所現有科研人員29人，包括教授8人，副教授8人，講師5人。其中國家杰出青年基金獲得者2人、“新世紀百千萬人才工程”國家級人選2人、國務院政府特殊津貼獲得者1人、教育部新世紀優秀人才1人、中國青年科技獎獲得者1人、國際相關專業委員會副主席1人。近五年來，主持國家杰出青年科學基金課題2項，國家自然科學基金重點項目2項，國家自然科學基金重大國際合作項目1項，“973”計劃項目子課題2項，“863”項目2項，國家自然科學基金面上項目28項等在內的各類基金課題124項，合同經費達3911.47萬元。獲省部級科技進步二等獎2項；獲國際及國家授權發明專利12項；出版專著、教材3部；發表科研論文297篇（其中SCI論文113篇）。成立了吉林省人獸共患病學會，并成功申辦了第十三屆國際旋毛蟲病會議（2011－長春）。
研究所現有科研用房3500㎡，擁有近3000萬元的大型儀器設備，其中包括透射電鏡、掃描電鏡、激光共聚焦顯微鏡、流式細胞儀、2-D雙向電泳系統等先進儀器，從而為開展各類相關研究提供了良好的硬件平臺。
