“綠洲生態教育部重點實驗室”主要從事綠洲生態為主的應用基礎研究。綠洲生態實驗室始建于1997年，1998年成為新疆大學“綠洲生態與荒漠重點實驗室；2002年經自治區人民政府批準，成立“新疆綠洲生態重點實驗室”（省部級開放實驗室），2003年“新疆綠洲生態重點實驗室“被教育部批準進行省部共建，成立“綠洲生態教育部重點實驗室”，實驗室現有固定研究人員55人，其中教授15人（博士生導師8人），副教授、副研究員27人，講師、工程師13人。
同時本實驗室還聘請國內外知名專家、學者26人作為客座研究人員進行科學研究、人才培養工作。實驗室現有儀器設備價值2130.5萬元。實驗室擁有科研用房3100平方米。實驗室建有“教育部西部資源環境網上研究中心新疆分中心”，建有中國西部干旱區本底資料數據庫、研究成果庫、文獻資料庫。
實驗室與國外科學家廣泛合作，于2002年成立“干旱區半干旱區可持續發展國際研究中心”，2004成立了中國科協第一家“海外智力為國服務工作基地”，聯合國教科文組織已將其納入到亞洲區域干旱區網絡研究項目中。有近百名中外科學家參與研究，形成了一支中外合作系協同攻關并與國際研究前沿接軌的高水平研究隊伍。
依托實驗室建有生態學、礦產普查與勘探兩個自治區重點學科，同時，生態學為新疆大學“211工程”重點建設學科。目前建有環境科學、生態學、自然地理學、地圖學與地理信息系統、人文地理學等8個碩士學位授予點；自然地理學、生態學、人口資源環境經濟學三個博士點；設有生態學項目博士后流動站。
主要研究方向
重點建設干旱區綠洲生態學、干旱區資源環境學，形成在國內外具有優勢和特色的綠洲生態、干旱區資源環境學學科，帶動其他學科的發展，研究達到國內領先水平。以綠洲生態過程與適應、生態修復與安全、系統模擬與預測、生態經濟與資源利用為主要研究方向，瞄準國際前沿水準，解決重要基礎理論問題，以期實現綠洲研究的理論突破；解決西部生態環境所面臨的重大理論和實踐問題，建立干旱區退化生態系統恢復重建的技術體系，達到改善西部干旱區生態環境，恢復已退化生態系統的目的。
