針灸與時間生物學實驗室的前身是1973年成立的針麻與經絡研究室，1981年經四川省人民政府批準成立中醫基本理論研究室，1999年成為四川省高校重點實驗室，2002年成為國家中醫藥科研三級實驗室，2008年成為四川省重點實驗室，是針灸推拿國家重點學科和我國西部地區針灸研究的重要基地。
實驗室下設人體節律實驗室、動物節律實驗室、分子生物學實驗室、代謝組學實驗室、生物芯片實驗室、行為學實驗室，專用實驗室面積800平米，擁有儀器設備120臺件，擁有儀器設備價值900余萬元，其中10萬元以上大精設備20臺。擁有獨立知識產權并被國內同行廣泛運用的“生物節律自動監測與分析”核心優勢技術和代謝組學、生物芯片等國內領先實驗研究技術。
實驗室科研技術團隊共20人，平均年齡41歲。實驗室擁有專職研究人員12名，實驗技術人員5名，管理人員3名，兼職研究人員4名，國內外客座研究人員8名。專職人員中有正高職稱8人，副高職稱6人，中級職稱4人，初級職稱2人；博士后1名，博士6名，碩士5名，學士6名，其他2名；其中擁有973項目首席科學家1名、國務院政府津貼獲得者3人、教育部新世紀優秀人才1名、四川省學術技術帶頭人3名、四川省學術技術帶頭人后備人選3人。
實驗室長期從事中醫針灸的基礎研究工作，一直以時間醫學與時間針灸、經穴效應規律與原理、針灸神經康復作用與原理、針灸抗炎鎮痛作用與原理等作為主要研究方向，尤其是時間醫學與時間針灸研究領域擁有雄厚的研究實力，優勢明顯，特色突出，學術影響廣泛。
近三年來，實驗室共完成國家級課題11項、部省級課題8項，獲得四川省科技成果一等獎1項、部省級科技成果二等獎5項、三等獎1項，發表學術論文130余篇，其中SCI 收錄11篇?，F承擔國家級課題15項、部省級課題6項，研究經費達到3000余萬元。
實驗室目前承擔全校碩、博士研究生《針灸推拿現代研究進展》、《實驗針灸學選論》、《時間醫學選論》、《時間醫學專論》、《醫學實驗技術與方法》等課程的教學任務，近兩年培養畢業碩、博士研究生45名。
