江蘇省特色水產繁育工程實驗室2011年經江蘇省發展和改革委員會批準成立，該實驗室由淮陰師范學院生命科學學院，并聯合中國科學院水生生物研究所淮安研究中心、淮安市水產技術指導站、洪澤縣水產良種場、新大運生態農業開發公司等單位共同建設。
實驗室緊緊圍繞特色水產繁育開展研究工作，主要任務是開展特色水產品增養殖技術、種苗工程、營養與病害防治等技術研發與產業化示范，提升江蘇特色水產核心競爭力。
實驗室科研人員結構合理，學歷和職稱層次較高。研究團隊現有專職研發人員29人，其中教授（研究員）6人，副教授（高級工程師、副研究員）7人，具有博士學位13人，團隊中，有中科院“百人計劃”人才1人。
實驗室擁有室內激光共聚焦顯微鏡、電感耦合等離子體發射光譜儀-ICP、傅立葉變換紅外光譜儀-FTIR、核磁共振波譜儀（NMR）、臺式高速冷凍離心機、基因擴增儀、室內循環水養殖系統、孵化系統等大中型儀器和設備，并擁有1000畝水產養殖基地。
