1996年，南京醫科大學以“生殖醫學”作為特色方向，通過多學科交叉組合，組建了生殖醫學中心。1997年江蘇省政府正式批準成立江蘇省生殖醫學重點實驗室，2004年入選成為科技部和江蘇省共建的國家重點實驗室培育點。在2005、2007和2010年江蘇省省級重點實驗室檢查評估中，本實驗室評估成績優秀，2005年成為江蘇省國家重點實驗室培育建設點，2008年又成為國家人口和計劃生育委員會生殖醫學重點實驗室，2011年3月生殖醫學實驗室被科技部批準立項籌建國家重點實驗室。
研究方向
一、配子發生的分子機制
研究內容：重點研究人類配子發生過程中遺傳信息穩定傳遞的分子機制。
預期目標：揭示配子發生過程中關鍵基因／蛋白的功能，為其他三個研究方向提供理論依據。
二、配子發生障礙的病理
研究內容：重點研究我國常見環境因素、遺傳因素、環境-基因交互作用以及代謝等疾病對配子發生的影響。
預期目標：闡明不孕不育發病機制，為制定相關環境監測、人群暴露和職業衛生標準提供科學依據。
三、不孕不育診治與出生缺陷防范
研究內容：重點研發和優化不孕不育診治的輔助生殖技術；開展出生缺陷的篩查與治療。
預期目標：應用研發和優化的輔助生殖技術，提高不孕不育診治水平和降低子代出生缺陷的風險。
四、生殖內分泌激素與相關疾病
研究內容：重點研究雌／雄激素對配子發生、腫瘤生成、以及對組織器官生長、發育、衰老的影響和機制。
預期目標：闡明雌／雄激素分泌紊亂導致靶器官相關疾病發生的分子機制。
