麻醉學基礎理論與應用研究實驗室于2001年5月，被省教育廳批準成為黑龍江省高校重點實驗室。經過不斷的建設，于2006年以優秀的成績通過省高校重點實驗室的驗收。
實驗室有穩定的研究方向，在麻醉學的基礎理論與應用方面的研究得到了提高，尤其在圍術期器官功能保護方面研究取得顯著成效，培養了博士研究生18人，碩士研究生72人。獲得不同層次課題 55 項，其中國家自然科學基金6項，獲得教育部科技進步二等獎1項、中國高?？萍歼M步二等獎1項、省政府科技進步二等獎1項、三等獎3項，發表科技論文140篇，發明國家新型專利2項。
實驗室建立了麻醉學相關的研究平臺，增添了許多大型的設備，如流式細胞儀、氣質聯用儀、高效氣相色譜儀、液相色譜儀、凝膠成像儀、熒光顯微鏡、膜片鉗、16導多功能生理監測儀、PCR儀等，滿足了麻醉學基礎理論與應用研究所需條件，并為繼續深化或拓寬領域的研究奠定了基礎。本實驗室已成為國內麻醉學界一流的實驗室，日本麻醉學專家小林 勉教授曾在此實驗室工作。
