獸藥系是學院特色教學系部之一，開設有“獸藥生產與營銷”、“獸醫醫藥”、“生物制藥技術”、“藥品質量檢測技術”4個專業。
該系師資學術水平較高，實踐經驗豐富，年齡、學歷、職稱結構合理?，F有專業教師32人，其中教授3人、副教授12人，具有碩土以上學位25人，省教學名師及優秀教師2人、教育部高職高專教學指導委員會委員1人、農業部新獸藥審評委員會委員1人、中國畜牧獸醫學會藥理毒理學分會常務理事1人、濰坊市畜牧行業協會專家委員會委員1人、濰坊市獸藥飼料研究學會委員1人、農業部農業特有工種技能鑒定高級考評員8人，另聘請了20多位企事業單位的專家作為該系學生實踐指導教師。
該系科研能力較強。先后主編、副主編教育部、農業部“21世紀國家高職高專規劃教材”12部，參編30余部；在國家及省級專業期刊發表論文300余篇，獲省部級以上教學、科研成果獎10余項，參與國家級精品課建設1項、省級精品課程4項。
該系實驗實訓條件先進。建有儀器分析室、理化分析室、抗生素效價測定室、藥物合成實訓室、生物制藥實訓室、藥物制劑實訓室、中藥鑒定實訓室、中草藥標本室等16個重點專業實驗室，配備了“高效液相色譜儀”、“抗生素效價測定儀”、“雙波長紫外分光光度計”、“薄層色譜儀”等高精密儀器和噴霧干燥、冷凍干燥、制劑生產、微生物發酵等生產實訓設備；建有中草藥標本園、教學動物醫院、GMP獸藥實習藥廠、藥品質量監控中心、動物疫病檢測實訓中心等5個校內實訓基地，及校外實訓基地40余處，為培養高技能醫藥人才提供了良好的教學實訓條件。
所培養的畢業生崗位適應性強、綜合素質高，崗位需求量大，初次就業率在99%以上。
