機電工程系源于1958年的機械系，至今已有50余年的辦學歷史。現開設有數控技術（示范院校重點建設專業）、機電設備維修與管理（示范院校重點建設專業群專業）、模具設計與制造（示范院校重點建設專業群專業）、輪機工程技術（中央財政重點支持建設專業）、船舶檢驗（“十二五”重點建設專業）、計算機輔助設計與制造（示范院校重點建設專業群專業）等專業，面向全國招生，面向全國就業。該系擁有一支結構合理、愛崗敬業、綜合素質較高的師資隊伍，現有50余名專兼職教師，其中副教授、高級工程師以上高級職稱人員20余人，碩士研究生以上學歷20余人，“雙師教師”24人，江西省中青年骨干教師、學院骨干教師6名，國家職業技能鑒定考評員15名。各專業教師近3年承擔省廳級課題20余項，發表論文100余篇，主參編教材20余部，獲評省級精品課程2門，省級精品資源共享課1門，全國優秀多媒體課件三等獎1項，省級優秀多媒體課件比賽一等獎和三等獎各1項。
機電工程系建有一棟7000余平方米的現代化實訓大樓，設有數控加工、模具拆裝、特種加工、電工電子、金屬加工、鉗工、塑料成型、沖壓成型、產品設計、機電設備維修、船舶動力設備拆裝、船員安全培訓、船員適任培訓、船舶檢驗等多個實驗實訓室及生產性實訓基地，有省內高校中最先進的TOM 2203B數控龍門銑床、VMC 1890、VMC 1270大型四軸加工中心、裝備最完善的船員遠程考場等教學儀器設備，總價值達1000余萬元。機電工程系始終堅持校企合作、工學結合的人才培養模式，先后與江西佳時特數控技術有限公司、德昌電機（深圳）有限公司、江西遠洋運輸公司、江西省港航建設投資有限公司、中山市歐帝爾電器照明有限公司、南昌海立電器有限公司、各船務公司、海事局等省內外企事業單位建立合作關系并設有實習基地。優越的實訓、實驗環境和教學儀器設備為培養學生的實踐技能和提高就業競爭力提供了優良的條件。
機電工程系除承擔本系各專業的教學與研究外，還承擔了汽車工程系、成教部等其他系部的部分課堂教學和實踐教學任務。
機電工程系培養了大批高端技能型專門人才，畢業生遍布全國各地，能較好地適應我國裝備制造業、水上運輸業及相關行業的要求，深受用人單位的歡迎，近年來畢業生一直供不應求。
