但“985”大學總體生源質量也存在明顯差異，在別敦榮的研究中，排名最前的清華大學得分為98.69分，排名最末的西北農林科技大學得分為13.07分。
以兩校2011年在河南錄取的理科平均分數為例，西北農林科技大學為603分，清華大學高達683分。
據武書連在其制作的《2012中國大學本科畢業生質量100強》表格中顯示，“生源質量排名”前9位全部由“985”大學占據，依次是清華、北大、中國科大、上海交大、復旦、浙大、人大、南京大學。外交學院排在了第十位。
武書連告訴中國青年報記者，“生源質量排名”所依據的主要是新生錄取分數線。
不過，“985”大學也受到了一些熱門專業大學的競爭，如外交學院、國際關系學院等外交類專業院校，對外經貿大學、中央財經大學等經濟類專業院校，北京外國語大學、上海外國語大學等外語類專業院校。這些院校的高考平均錄取分數線，大多能排在全國的前20名之內，錄取分數遠遠高于“985”大學中錄取分數靠后的大學。
作為專業院校，南方科技大學是第一所躋身于生源質量排名前列的純理工科大學。
在武書連的“生源質量排名”中，西北農林科技大學被排到了第120位。
在武書連看來，地理位置、校名、心理等因素會影響學生填報志愿。一些專業院校之所以有競爭性，比如涉及到“外”類的學校容易出現高分，是因為考生會因此憧憬今后的生活。“財”類的學校則會產生“錢”的聯想，農林類大學難招生，因為考生馬上就聯想到貧困的農村。
部屬高校生源地方化問題仍嚴重
別敦榮的研究還顯示，“985”大學錄取人數具有明顯的屬地化特征，優質生源青睞經濟發達地區的“985”大學，處在經濟發達省區的“985”大學更容易獲得優質生源。
例如，北京、上海、江蘇三地的經濟發展水平在全國處于領先地位，這些地區的“985”大學也獲得了相對較好的生源，生源質量排名靠后的大學主要分布在邊遠省份。全國各地絕大部分優質生源選擇了清華大學、北京大學、上海交通大學等地處經濟文化發達城市的大學，其他內地大學對它們幾乎沒有構成生源競爭威脅。
但在北京和上海之間，仍存在差距，比如，地處上海的復旦大學、上海交通大學，在本地招收的生源質量也比北京大學、清華大學弱。
別敦榮告訴中國青年報記者，造成“985”大學優質生源地域差異的原因，表面上看，是由于“985”大學招生錄取人數和錄取分數的差異，即源于我國高等教育分省招生計劃制度。但從根本上說，是因為各省市經濟、文化、人口、教育等發展不均衡的特殊國情。經濟發達的城市和地區對“985”大學支持力度更大，具有更富吸引力的文化影響，能夠提供更多的就業機會，考生更愿意報考分布在這些地方的“985工程”大學。
數據統計也顯示，2007年，34所一期“985”大學共招生14.6萬人，其中，各“985”大學屬地化比例平均值高達36.18%。
記者統計也發現，浙江大學連續數年以60%以上的本地生源比例，高居部屬院校本地生源比例排行榜首位。另外，南京大學、復旦大學、華南理工大學的生源本地化現象也非常嚴重。而教育部期待的數據是30%以下。
屬地化比例平均值高達36.18%，而“985”大學在另外13個無“985”大學省份的招生比例平均僅為1.75%，兩者之間出現的巨大差距，也說明了當前高考錄取結構的嚴重失衡。
