應用真菌重點實驗室前身為山東省高校應用真菌重點實驗室，目前有真菌多糖、菌根真菌以及生防真菌三個穩定的研究方向。截止到2009年，實驗室承擔科研項目50項，科研經費4456萬元，發表論文319篇，被SCI收錄31篇，專利9項，獲得省部級獎勵17項。實驗室在研人員27人，其中享受國務院特殊津貼專家2人，博士生導師3人，碩士生導師13人，具有高級技術職稱22人，占總人數的81%；博士17人，總人數的63%。45歲及以下青年研究人員14人，占總人數的52%，研究隊伍專業結構和年齡結構合理。實驗室占地1830平方米，擁有全自動液體發酵系統、多功能活性物質提取系統等國內先進水平的大型儀器，其中10萬元以上的設備有28臺（套），儀器設備原值1386萬元。經過多年的建設與發展，現已成為應用真菌領域的教學、科研基地，在國內外享有一定的聲譽。
