結構工程實驗室組建于1979年， 1999年被認定為交通部重點實驗室（現更名為“橋梁結構工程交通行業重點實驗室”），2000年被認定為重慶市重點實驗室，是“橋梁與隧道工程”學科(重慶市和交通部重點學科)的重要科研基地，是西南地區規模最大的橋梁及結構工程實驗室之一。
結構工程實驗室實行開放的運行管理體制，建立了較為完善的管理制度。由實驗室學術委員會提出研究方向、發展目標及建設任務，指導實驗室學術活動，審定實驗室發展規劃和實驗室開放課題；由實驗室主任管理實驗室日常事務、制定實驗室發展規劃、實施對外服務工作。實驗室主任為梁波教授，學術委員會主任為鄭皆連院士。
實驗室已有建筑面積4847m2，已完成基本建設和設備總投資近3900萬元人民幣。擁有包含五通道結構動態試驗系統(MTS) 、材料試驗系統、64通道動態信號采集及分析儀、24通道動態信號采集及分析儀、10000kN壓力試驗機、多種大型的反力設備（反力架、反力墻、建研式加載機）、SUN-ULTRA 60計算機工作站、MSC／NASTRN及MSC／MRAC2001有限元分析軟件、UCAM-70A-10、7V14日產數據采集器等設備和軟件約568臺（套），設備總值近2300萬元人民幣。
作為“橋梁與隧道工程”學科的依托，結構工程實驗室承擔西南地區橋梁與結構工程的理論與實驗研究工作，是我校進行科學研究與培養高層次專業技術人才的平臺。目前，結構工程實驗室有固定研究人員32人（教授12人、副教授14人，其他人員6人），其中全國優秀科技工作者1人、國家級有突出貢獻的中青年專家1人、“百千萬人才工程”國家級人3人、重慶市學術技術帶頭人8人、交通部科技英才3人，具有博士學位者10人；聘請特聘教授1人（工程院院士鄭皆連）、客座教授10人。
實驗室根據長期的科研工作基礎和技術優勢，確定了如下多個研究方向：“大跨徑橋梁設計理論與工程控制”、“混凝土橋梁結構行為與新技術研究”、“橋梁結構損傷機理與耐久性研究”、“橋梁深基礎及地下工程設計理論與關鍵技術研究” 、“長大公路隧道設計理論與施工關鍵技術研究”。支撐著“橋梁與隧道工程”博士點以及土木工程一級碩士點和“工程力學”碩士點，培養博士、碩士研究生600余名（含在讀研究生）。
作為西部地區主要從事橋梁與結構工程試驗研究的重點實驗室，實驗室充分利用西部大開發、交通大發展、重慶大建設的良好機遇，針對西部和西南地區橋梁、隧道建設的難題，結合自身研究特色和優勢，完成了大量國家重大、重點項目的關鍵科研試驗任務，獲得了一批國內外有影響的優秀成果。近5年來，以重點實驗室為平臺，實驗室研究人員承擔科研項目200余項，科研經費6000余萬元，其中省部級以上項目49項；發表論文300余篇、出版教材及專著27部、獲國家發明和實用新型專利10項；獲國家科技進步獎一等獎、二等獎、三等獎各1項，交通部科技進步特等獎1項，省部級科技進步獎24項。
