信息系統安全教育部重點實驗室是國內第一個以信息系統安全作為研究對象的國家級科研機構。實驗室將以系統的觀點研究與信息系統相關的物理層、網絡層、系統軟件層、應用軟件層及管理體系等五個方面的信息安全，并針對基于網絡而建成的新一代信息系統的復雜多變的安全問題，研究更完善、有效的安全策略與支撐體系，從信息安全對國家安全的基礎和根本出發，為我國信息系統安全建設提供技術、人才支持和支撐。
目前實驗室建有一支32人的高水平科研隊伍，其中，院士1名，杰出青年基金獲得者2名，46％的教師有海外留學和工作經歷。近五年來，實驗室共培養信息系統安全方向研究生35名，其中博士研究生6名，博士后3名。目前在讀本方向博士研究生12名，碩士研究生56名。
除上述固定研究人員外，實驗室學術委員聚集了一批國內信息系統安全領域知名專家，如中國工程院院士李德毅、魏正耀、方濱興、陳佐寧，也有國家主管部門、關鍵行業的技術專家。同時，實驗室還與國際上十余所知名大學建立了良好的合作關系，每年都有互派訪問、交流活動。
