廣州市第二中學創建于1930年8月，現應元路21號校區是廣州二中的母體，她曾是清代嶺南著名的書院學海堂、菊坡精舍、應元書院的所在地，書香濃郁，聞名遐邇。近代嶺南的風流人物陳澧、朱次琦、梁鼎芬、梁啟超等都曾在這塊土地上學習過。1871年（清同治十年），在應元書院攻讀的順德舉人梁耀樞高中辛未科狀元，被傳為"應元佳話"--風流人物輩出，給斯地賦予了神奇與靈秀。
應元路21號校區現為我校初中部，她北倚風光秀麗的越秀山，南臨雄偉壯麗的中山紀念堂，毗鄰省、市政府。早在1956年，學校就被廣州市人民政府評定為廣州市重點中學；1994年被評為廣東省首批省一級學校。
2005年9月啟用的科學城校區，是我校的高中部。她地處蘿崗區科學城內的水西路上，毗鄰新興的蘿崗行政中心區，倚蘇元山（相傳唐宋八大家之一的蘇東坡曾在此結廬而讀，因得名）而建。校區內有天然山水匯聚成湖，是一所以"山水學府，生態校園"為理念構建而成的現代化一流學校。學校占地面積300畝，其建筑布局合理，氣勢恢弘，設計規模為60個教學班，3000名學生，為一時之最。2007年，學校在廣東省普通高中教學水平評估中達到優秀學校標準，并順利通過廣東省國家級示范性普通高中驗收。
