自動控制工程系是遼寧機電職業技術學院的主要教學系部之一，現有電氣自動化技術、電子儀器儀表與維修、生產過程自動化技術、機電一體化技術應用、自動化設備及應用、電子信息工程技術6個專業，一個電工電子自動化技術工程中心。
目前在校生1100余人，擁有一支以中青年教師為主的實力雄厚的師資隊伍，其中專職教師30人（高級職稱51%），雙師型教師85%。
自動控制工程系始終堅持以培養生產、建設、服務與管理一線人才為目標，堅持高職教育的辦學模式和方向，注重對學生綜合素質、實踐動手能力和敬業、創業精神的培養。全系各專業的設置緊緊圍繞遼寧經濟建設主戰場，與地方的產業結構和人才需求相適應。為培養名符其實的高等職業技術人才，自動控制工程系在校內建立了11個專業實驗、實訓室,與校外企業合作，建立了穩定的實習基地。學生通過實訓和實習，不僅將所學理論與實際緊密相聯，學習到了職業崗位上有用的先進技術和管理方法，而且得到了很好的職業素質和職業道德的訓導。這些學生走向工作崗位后，有的不久就獲得高級工或技師資格，有的走向領導崗位，而大多數則以動手能力強、好用、管用深受企業歡迎。他們在不同工作崗位上，向社會展示了機電類高等職業教育人才的獨特魅力
自動控制工程系始終堅持走產、學、研相結合的可持續發展的道路。全系教師積極參與教學研究、教學改革和科研開發，近兩年先后在國家、省、市等刊物發表論文80余篇，20名教師參與相關專業教材主編及參編，2名教師為國家教育部下設專業指導委員會委員，完成10項省市級教科研項目，獲遼寧省第五界優秀教學成果二等獎一項，獲丹東市科技成果一項，四門課程被評為省級精品課程，兩門課程被評為院級精品課程。目前自動控制工程系已形成融控制技術、信息處理技術、電子技術、計算機控制技術為一體的綜合性學科體系。其中電氣自動化技術專業為國家級試點專業，是遼寧省教育廳首批高職示范專業和品牌專業，電氣自動化技術專業教學團隊為遼寧省優秀教學團隊。2007年全國大學生電子設計競賽中，獲國家一等獎一項、獲省級特等獎兩項、獲得省級一等獎兩項、獲省級二等獎一項、獲省級三等獎一項。2009年全國高職技能大賽電子產品設計制作項目競賽中獲全國一等獎。
自動控制工程系在學生課余文化生活方面，緊密與專業相結合，拓寬學生的專業技能，相繼成立了，電子科技協會、電氣協會和單片機愛好者協會。開展了系列的專業性較強的培訓及技能大賽，為自動控制工程系參加各級大賽輸送了優秀人才，提高了學生專業課的學習興趣，得到了廣大師生的認可與好評。
