滄州醫學高等專科學校醫學技術系建立于2005年9月，包括眼視光技術、醫學檢驗技術、口腔醫學及口腔醫學技術和藥學專業。其中眼視光技術、口腔醫學為滄州醫學高等專科學校的特色專業，醫學檢驗技術為滄州醫學高等專科學校的教學改革試點專業。醫學技術系建立之前，這些專業屬于臨床醫學系。
醫學技術系師資力量雄厚，現有專任教師30名，其中具有高級職稱者11名，占36.6 %；具有雙師素質的教師16名，占53.3%；具有碩士研究生學歷者3名，占中青年教師的15%；還有正在攻讀術士學位的教師5名。醫學檢驗專業的侯振江教授連續三屆評為滄州市拔尖人才，并榮獲滄州市“十佳百星”稱號，眼視光技術專業的徐深教授為河北省有突出貢獻的中青年科學家。為強化實踐技能教學，實現學生在校學習與臨床實踐的零距離對接，我們還聘請了醫院、藥廠等單位的具有實踐經驗的專家及能工巧匠作為兼職教師。該系注重科學研究與教學研究，近三年來，全系教師主編和參編教材8部，在各類專業雜志上發表論文數十篇，承擔省科技廳課題3項，其中一項獲河北省科技進步三等獎，承擔市、校級課題多項。
醫學技術系校內實訓室和校外實訓基地實驗設備齊全，校內實訓室面積1000余平米，儀器設備總值達300余萬元。眼視光技術專業有驗光室、配鏡室、隱形眼鏡室和眼科檢查室，配備有視力檢測器、電腦驗光儀、全自動磨邊機、同視機、電腦焦距儀等全套的檢測、眼光、配鏡設備，目前正在籌建驗光配鏡實訓中心，使學生進行仿真訓練；醫學檢驗專業有臨床檢驗、生化檢驗、血液檢驗、微生物檢驗、寄生蟲檢驗和免疫學檢驗實驗室，配備有多媒體血細胞分析系統、酶標儀、血凝儀、電解質分析儀、尿液分析儀、電容掃描儀等；藥學專業有天然藥物學、天然藥物化學、藥劑學和藥物分析實驗室，配備有紅外光譜儀、氣相色譜儀等；口腔醫學和口腔醫學技術專業有鑄造室、烤瓷室、口內、口外、修復口腔臨床模擬實驗室，配備有完備的口腔臨床模擬教學系統，還有口腔醫學技術實訓中心。校外實訓基地有附屬眼科醫院、口腔醫院，還有天成藥業和萬歲藥業，基本滿足了專業教學和實踐技能學習的需要。
醫學技術系遵循學校一貫堅持的社會主義辦學方向和科學發展觀，認真貫徹黨的教育方針，遵循“以能力為本位、以學生為中心”的辦學原則，堅持“以服務為宗旨、以就業為導向，走產學研相結合道路”的高職高專辦學方針，緊貼地區經濟社會和行業發展的需求，不斷強化專業建設，積極探索人才培養模式、課程體系、教學模式、教學方法和教學管理的改革，為醫藥衛生第一線培養需要的“下得去、留得住、用得上”、實踐能力強、具有良好職業道德的高技能人才。眼視光技術專業的畢業生就業率100%，其他專業畢業生的就業率也在95%以上。
在新的世紀，醫學技術系將遵循學校立足滄州，輻射周邊，服務河北，面向全國的辦學思路。全系教師會更加銳意進取、開拓創新、努力拼搏，為醫學技術系的更加輝煌而努力。
