建筑工程系是內蒙古建筑職業技術學院成立最早、師資力量最雄厚的重點系之一。下設建筑工程技術和工程測量技術兩個專業，其中建筑工程技術專業是學院重點建設的品牌專業之一，也是教育部批準的國家級教學改革試點專業之一。
建筑工程系共設四個教研室：建筑施工教研室、土木結構教研室、工程測量技術教研室和建筑材料教研室，現有教職工81人，其中副高級以上職稱20人，中級職稱26人，“雙師型”素質教師達80%以上，博士在讀2人，碩士研究生31人，本科以上學歷75人。建筑工程系獲自治區先導型系、自治區教育先進集體，其中《“2+0.5+0.5”人才培養模式研究與實踐》獲得了自治區教學成果一等獎。
建系以來，為國家和自治區培養了多批建設及相關行業急需的應用型人才。本系各專業的就業形勢良好，部分專業甚至出現供不應求的現象。所有專業在每年9月份一次性合同簽約率均在95%以上，年內就業率可達100% 。
