機電工程系是六安職業技術學院重點建設的教學系之一?，F有機械類、電氣類和汽車運用三大專業群，設有機電一體化、數控技術、計算機輔助設計與制造、模具設計與制造、電氣自動化、供用電技術和汽車運用技術七個專業，2008-2009學年在校學生2047人。 2009-2010學年在校學生2171人。
機電工程系積極探索具有高職特色的“二堅持，三適應，二雙制”的人才培養模式。即堅持以服務為宗旨，以就業為導向，堅持以技術應用能力為主線；專業設置與社會需求相適應，培養目標與用人標準相適應，技能訓練與崗位要求相適應；雙教學大綱（理論和實踐），雙證書（學生獲得畢業證書和職業資格或技能等級證書），努力培養生產、服務、管理一線需要的高級技能性應用人才。
機電工程系重視教師隊伍建設。全系現有教職工61人，（其中專職教師59人、兼職教師2人、校外兼職教師8人、校外兼課教師15人），副教授、高級工程師等高級職稱教師12人，講師、工程師等中級職稱教師9人；碩士研究生及在讀研究生12人；技師和高級技師5人；“雙師型”教師26人。為了進一步提高辦學水平，充分利用社會力量，機電工程系聘請了三位客座教授。近年來院、機電工程系利用寒暑假，連續選派專業教師赴高校、企業進行業務水平和實踐操作技能的培訓，為培養合格人才提供師資保障。
學院重視機電工程系的建設，建立了與專業教學相配套的實驗實訓室。本系擁有電子拖動、維修電工、電子工藝、汽車示教、發動機拆裝、模具陳列、普通車床、鉗工、焊接、制圖測繪、計算機仿真、PLC、數控編程與仿真、公差測量、液壓與傳動、CAD/CAM、數電模電等17個實驗（訓）室和數控加工實訓、計算機兩個中心，教學條件能滿足各專業人才培養的要求，保證各專業人才的培養規格。
機電工程系重視畢業生就業工作。根據經濟社會對專業人才的需求，廣泛開展專業論證和市場調查，瞄準生產、管理、服務的一線，以提高教育教學質量為核心，堅持“以人為本、依法治校、質量為先、特色競爭、和諧發展”的辦學理念，專門開設了學生素質和就業指導課，努力提高畢業生的就業率和就業質量。2006年全系畢業生的平均就業率為99.13%，2007年畢業生的平均就業率99%，2008年畢業生的平均就業率100%。2009年的統計就業率為100%，位居全省高校就業率前列。
機電工程系將秉承“自強不息、志存高遠、勇于奉獻、團結奮進”的校園精神 ，努力“培養既具備一定科學人文素質，又掌握一定專業技術技能，具有良好職業道德和敬業精神的高素質技能型專門人才；使學生學會做人、學會做事、學會生存、學會學習，夯實學生成才的基礎” 。為在“十一五”期間創建“省級示范高等職業學校”的總目標而努力奮斗！
