福建交通職業技術學院交通土建工程系組建于1999年7月，其前身是成立于1974年的福建交通學校公路與橋梁專業。
現開辦有道路橋梁工程技術，建筑工程監理，建筑工程項目管理，市政工程技術，港口工程技術，房地產經營與估價、工程測量七個專業，目前在校生超過1600名。是培養土木工程類、土木工程管理類高素質、高技能應用型人材的教學單位。
交通土建工程系擁有一支素質優秀、專業配套、結構合理的師資隊伍，有教授１名、副教授（高級工程師）7名、講師（工程師）25名，其中雙師素質占師資總數80%以上，絕大多數教師具有碩士以上學位。能夠熟練地講授各專業主干課程、指導專業實習實訓課程，能夠滿足高等職業教育對師資的理論教學和實踐教學的要求。
交通土建工程系堅持教學與科研并重，積極參與海峽西岸經濟區交通建設，系部成立以來，完成多項交通科研課題和對外技術服務，出版教材12部，公開發表論文60多篇。
交通土建系教學儀器設備優良。在校內設有建筑材料、工程測量、工程結構檢測、土建工程專業軟件等8個實訓室，與福建省14家大型或知名企業建立了長期穩定的合作關系，并作為會員單位與福建省公路學會，道路學會，橋梁與結構學會，港口學會等多家行業協會保持著密切的聯系。這種全方位的合作辦學，不僅為教學提供了實訓場所，使學生及時地掌握了最新的實際操作技術、手段和管理方法，而且也為企業輸送合格的畢業生，為學生拓寬了就業渠道。
