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學校擁有優良的教學科研基地和實踐教學基地，有1個國家重點野外科學觀測臺站（即帽兒山森林生態系統定位站）；有森林植物生態學、生物質材料科學與技術、林木遺傳育種與生物技術、東北油田鹽堿植被恢復與重建（立項建設）4個教育部重點實驗室，4個國家林業局重點實驗室，5個省級重點實驗室，7個省教育廳重點實驗室；有1個教育部工程研究中心，1個高等學校學科創新引智基地，2個國家林業局生態系統定位研究站，1個省中試基地，2個省普通高校人文社會科學重點研究基地，2個省中小企業共性技術研發推廣中心；有東北林業大學大慶生物技術研究院、植物資源生態與分子工程研究院等37個研究機構；有帽兒山實驗林場、涼水實驗林場等10個校內實習基地和190個校外實習基地。
