園藝系始建于1948年，與學院同時建立，是黑龍江農業職業技術學院建立最早的骨干系之一。園藝系經過六十多年的發展，現已成為師資力量雄厚，教學經驗豐富實驗設備較為完善的重點系部。
現有教職工26人，專任教師20人，農業生產技術管理人員3人，實驗指導教師2人，實驗室及實訓基地管理人員2人。專任教師職稱結構為：教授2人，副教授5人，中級講師13人。學歷結構為博士1人，碩士9人，學士18人，其中省級學科帶頭人3人，高級工程師及高級農藝師4人，雙師型教師15人。
系內教師不但具有豐富的教學和實踐經驗，還具有較強的科研能力，現已獲多項省市級科研成果。2000年以來園藝系教師主編參編國家、省、市教材40余本；由園藝系的教師主持完成或正在進行的國家、省、市級、校級科研項目30余項。每年為縣鄉城鎮園藝園林產業技術服務100余次。 目前已在科研、著述、教學及服務社會等方面形成整體的團隊優勢，師資力量、科研實力居全院前列。通過產、學、研的科技平臺促進了東北地區園藝園林業，為“科技興省，科教興農”做出了重要貢獻，在省內同類專業享有很高的聲譽。
園藝系下設園林花卉教研室、園藝技術教研室、植物技術教研室三個教研室。開設有市場前景廣闊、就業渠道暢通的園林花卉技術、園林工程技術、園藝技術。實驗設備完善，設有綜合實驗室10個，分別為園藝實驗室、園藝標本實驗室、園林實驗室、園林設計實驗室、植物實驗室、植物標本實驗室、植物生理實驗室、氣象實驗室。
校內實訓基地2個。園藝園林實訓基地占地11公頃，內設日光節能溫室4棟，普通溫室2棟、智能化溫室1032m2 園林樹木區、小漿果區、宿根花卉區、草本花卉繁育區、盆花養護繁育區、蔬菜種植區。組織培養實訓基地450m2 ,內設準備室、接種室、培養室。校外實驗實訓基地44個。
黑龍江農業職業技術學院致力于建立“招生培養實訓就業聯動”機制，園藝系在上海、南京、浙江、山東、北京、天津、大連、哈爾濱等地建立了穩定的就業基地，積極與用人單位合作，推行“訂單”培養。畢業生供不應求，近年來，本科畢業生就業率一直穩定在98%以上。
