沈陽音樂學院“音樂舞蹈研究所”的歷史“源頭”可以追溯至學院的前身——延安魯迅藝術學院音樂系于1939年3月成立的“中國民間音樂研究會”。
作為抗戰時期革命根據地的音樂研究機構，“中國民間音樂研究會”旨在開展有計劃、有組織地對民間音樂的采集、介紹與研究工作，同時組織專業音樂工作者對大量優秀的傳統戲曲、民歌、小調以及歌舞進行加工和改造，繼而為抗戰服務。
其間，呂驥、冼星海先后擔任過該會會長，向隅、李凌、梁寒光、安波、馬可、李煥之、李鷹航等音樂家均在該機構從事過音樂研究與創作。
1948年東北全境解放后，已遷至沈陽的“魯藝”（簡稱“東北魯藝”）在恢復辦學之際重建“音樂研究室”，主要工作為收集整理民間音樂、歌曲創作，并與東北文聯音樂工作委員會合編音樂刊物《東北歌聲》，研究室主任先后為安波、李劫夫、寄明、李純一等。
1953年2月東北“魯藝”改制后，其音樂系改稱為“東北音樂專科學校”（簡稱“東北音專”），“音樂研究室”因“東北音專”教學的需要改為教學型研究機構，先后分設過“共同課教研室”、“文史組”、“俄文教研組”、“民族音樂理論教研組”及“民族民間音樂研究室”。
其間，李純一、霍希揚、杜六石、張黎、鳴戈、楊普烈、馬炬、谷音、楊葉、常維孝、路逵震、周文謨、張正治、王鳳賢、張玉梅、周景春、孫靜云、關維珍、高厚永、杜素琴、曹正萱、李名崗等音樂理論家先后在此工作。
1958年“東北音專”轉制為沈陽音樂學院后，為加強學院的理論建設與專業基礎教學，學院于1960年2月8日在原有基礎上重組“音樂研究室”，并決定研究室為教學與科研并重的學術研究機構，主任為丁鳴（兼），副主任王鳳賢，支部書記鳴戈、副書記谷音、秘書陳崇，下設：民族民間音樂教研室，成員有楊葉、常維孝、周文謨、高厚永、王鳳賢、張玉梅、周景春、杜素琴、王瑞江。音樂史教研室，成員有杜六石、張前、馬炬、谷音、傅景瑞。音樂理論教研室，成員有鳴戈、楊普烈。外文教研室，成員有巖風、李名崗、李榮芹、李景蘇、張懷惠等。
“文革”結束后，學院于1978年4月恢復“音樂研究室”，一方面繼續保持科研與教學并重的模式，同時開始積極籌備成立“音樂研究所”。至1985年正式成立“音樂研究所”之前，研究室為王鳳賢任主任、馬炬任副主任、谷音任書記、李震任秘書。
下設民間音樂組，成員有楊葉、王鳳賢、張玉梅、周景春、杜素琴、楊久盛、李玉珍、譚家盛、顧梅羹、顧澤長。音樂史組，成員有杜六石、馬炬、谷音、傅景瑞、謝維廉、彭永啟、李震、王靄林等。外語組，成員有巖風、李名崗、曹正萱、張懷惠等。
1985年6月8日，經遼寧省教育局批準，沈陽音樂學院“音樂研究所”正式成立，任命谷音為研究所副所長（主持工作），其后歷任所長為王其慧（教學副院長兼）、凌瑞蘭、楊久盛、彭永啟，成員先后有張懷惠、肖斌、孫學武、譚家盛、房鴻明、路逵震、卜兵、朱默涵、王紅梅、傅景瑞、何迺欣、王寶龍、姚麗娟、徐朗等。
音樂學系于1999年10月27日，在堅持科研與教學并重的指導思想下，沈陽音樂學院將“音樂研究所”與音樂學系采取合一建制，任命彭永啟為音樂學系系主任兼“音樂研究所”所長。
音樂學系全體任課教師均為研究所研究人員，音樂學系各教學教研室為研究所各領域研究室性質的部門，成員先后有彭永啟、何迺欣、凌瑞蘭、李玉珍、楊久盛、張世澄、譚家盛、馮志蓮、王學仲、胡天虹、劉云燕、賀志凌、董蓉、梁雪菲、馬穎、馬莉嘉等。
2009年12月，根據學院發展的需要，沈陽音樂學院決定將“音樂研究所”單獨設立并將其重組為“音樂舞蹈研究所”，任命胡天虹為所長，主要負責學院重大科研課題的研發與學術活動。
目前，研究所的專職研究人員為重大科研項目（國家級課題）的主要責任人，其人員為（按課題立項時間為序）：楊久盛、劉輝、白瑋、馮志蓮、白寧、胡天虹、林林。研究所科研秘書：李露洋，行政秘書：董江華。
