傳染病診治國家重點實驗室依托浙江大學和國家傳染病學重點學科，由國家科技部主管，教育部托管。
在國家科技部、教育部、衛生部和浙江省委省政府的大力支持下，實驗室于2007年4月提出建設國家重點實驗室的申請，2007年9月建設計劃通過國家科技部專家組的論證，2007年10月正式獲得批準建設，目前正處于建設期。
現任學術委員會主任為中國工程院院士楊勝利教授，實驗室主任為李蘭娟院士。
實驗室融科研、醫療、教學為一體，定位于傳染病學診斷與治療的基礎研究與臨床應用研究，針對我國傳染病現狀，依據國家對重大傳染病防治的戰略規劃，圍繞傳染病的診斷和治療等科學前沿問題開展研究，重點研究解決嚴重危害人類健康的傳染病發病機制與診治的關鍵問題。
主要研究方向和內容為：
(1)病毒性肝炎發病機制及新型防治技術研究。
應用系統生物學、實驗動物學、再生醫學、藥物治療學的最新技術，重點在病毒性肝炎發病機制研究、肝炎病毒變異與耐藥機制的研究、人工肝基礎和應用研究領域開展研究。
（2）艾滋病等新發與再現傳染病研究。
在艾滋病/HIV 感染、禽流感等疾病的防治、其他新發與再現傳染病防治等方面進行重點研究。
（3）感染微生態和感染免疫研究。
重點對微生態與人類感染性疾病的關系、肝病微生態、重要病原體耐藥機制及機會性感染、感染免疫的細胞和分子機制等方面進行研究。
（4）傳染病診斷新技術研究。
重點在高通量、靈敏、精確、快速的新型診斷技術，高效、可靠、安全的新發傳染病病原體分離技術和設備，傳染病特異性細胞免疫診斷技術，以及傳染病相關的分子影像學等方面進行研究。
（5）傳染病治療的新技術與藥物研究。
將重點開展新型治療技術、傳染病治療新合成藥及現代中藥的創制、抗感染藥物不良反應等方面的研究。
實驗室在傳染病治療和診斷方面取得的主要研究成果有：
1、 人工肝研究處于國際領先水平。針對重型肝炎病死率高的難題，歷經多年攻關，創建了一套獨特有效具有自主知識產權的人工肝支持系統，探索確定人工肝在治療過程中的各種參數，攻克了人工肝基礎和應用中一系列的技術難關；探明了人工肝治療的適應證和禁忌證，極大地降低了患者病死率。
2、感染微生態學的建立及應用研究。將微生態學理論引入感染和肝病研究領域，創建了“感染微生態”學新理論，對肝病微生態和細菌耐藥進行了系列研究，提出了感染微生態防治新策略：用微生態學的理論和方法研究感染的發生、發展及轉歸過程，發現破壞人體微生態平衡會導致嚴重感染或臟器損害，該發現更新了抗感染策略。
3、病毒性肝炎研究方面。發現戊肝病毒新的抗原表位，探明病毒抗體的診斷意義，率先觀察病毒血癥及糞便排病毒規律，明確戊肝臨床隔離時間。
4、傳染病的診斷新技術研究獲得豐碩成果。發明了特異探針標記新方法，研制了一系列特異性高，通量更大的診斷芯片。
這些重要的研究進展和成果先后榮獲國家科技進步獎2項和省科技進步一等獎6項，其他獎勵上百項；發表了Nature immunology、PNAS等一大批高質量的學術論文；主編《傳染病學》、《人工肝臟》、《感染微生態》、《人類病毒性疾病》等教材和論著數十部；獲得國家發明專利授權數十項，并取得了良好的經濟效益和社會效益。
李蘭娟教授是我國傳染病臨床領域唯一的中國工程院院士，我國人工肝的開拓者。在她帶領下，實驗室擁有在國際上具有一定影響、基礎與臨床結合緊密、不同學科專業優勢互補的科技人才隊伍，包括“973計劃”首席科學家， “長江”特聘教授和“國家杰青”等一批思路活躍、勇于探索創新的青年骨干；
形成了院士領銜、教授支撐、青年骨干為主體的學術梯隊和年齡與知識結構合理、學歷層次高、專業覆蓋面廣、技術力量雄厚的學術隊伍?，F有固定人員70名，其中研究人員47名，技術人員23名，兼職管理人員2名。
實驗室實行“開放、競爭、流動、聯合”的運行機制，對國內外科研單位和大專院校開放各研究平臺。承擔了國家重大科技攻關、“973”、“863”等一大批國家及省、部級項目，還積極參與國內外知名大學、研究院所進行廣泛的合作與交流，多次應邀在國際重大學術會議上作專題報告，主辦或承辦大型國際會議，提升了實驗室的國際學術地位。
在依托單位浙江大學的有力支持下，實驗室將緊密結合國家重大專項，結合國家傳染病防治的長遠戰略和現實需要，針對傳染病病原體診斷和重要傳染病治療的關鍵問題，開展開拓性研究，進一步增強自主創新能力，承擔相關重大理論研究、高新技術研究及高水平人才培養工作，努力在傳染病診治方面取得突破性的創新成果，把實驗室建設成為具有原始創新能力的國際先進的科學研究和人才培養基地。
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