“污染控制與資源化研究國家重點實驗室” 1989年經國家計委批準，于1991年正式開始建設，1995年通過國家驗收，并正式對外開放，2000年4月、2005年4月兩次通過國家評估（B級）。
實驗室依托于同濟大學、南京大學環境科學與工程學科群，涵蓋環境科學、環境工程、市政工程三個博士點；環境科學、環境工程和土木與水利3個博士后流動站。中國工程院郝吉明院士現任學術委員會主任，學術委員會由環境科學與工程學科領域著名專家學者15人組成，趙建夫教授任實驗室主任，南京大學部分由實驗室副主任李愛民教授主持工作。
本實驗室作為國內環境科學與工程技術的研究基地，充分發揮同濟大學和南京大學理工結合的優勢，瞄準國家目標、學科前沿和技術需求，致力于污染控制和資源化兩方面的應用基礎研究，為遏制我國環境污染和生態破壞、有限資源的合理利用和促進社會與經濟可持續發展提供理論和先導性技術。
實驗室南京大學部分依托的南京大學環境學院，擁有環境科學國家重點學科，環境工程江蘇省重點學科，環境科學與工程國家一級學科博士學位授予權。在有機污染物生態風險、有機物結構活性相關、生態基準、稀土的環境化學行為和環境效應、高濃度難降解有機工業廢水處理及資源化集成技術、厭氧生物水處理機理研究及技術開發、水系水污染控制等方面開展了特色性的研究工作，形成了一支高水平的環境科學研究隊伍。
目前，實驗室圍繞我國環境保護所面臨的重大理論問題和技術需求，正在以下領域開展研究并取得了新進展。
一、生態風險與環境安全研究
1、研究復合污染物(有機物和金屬)在多介質、多界面復合體系的環境過程機制和生態效應。
2、典型有機污染物的三維分子結構與活性關系與混合有機污染物的結構-活性關系。
3、研究復合污染物的生態毒性及其微觀機理，篩選與建立早期預報的生物標志物和生態毒性診斷技術。
4、建立水、土壤環境生態安全評價方法體系。
二、污染水體和土壤的化學與生物修復原理研究
1、地下水體中污染物的阻斷及原位修復；含水層介質的潤濕性與污染物在地下介質孔隙中的分布關系及影響因素；污染物的生物降解；污染物在土壤-地下水中的界面傳輸過程、非均相物理化學反應及動態模型研究。
2、高效降解持久性有機污染物的微生物菌種的篩選及馴化，污染土壤化學-微生物-植物聯合修復機理研究，建立受污染土壤環境的生物修復理論、技術及安全評價體系。
3、飲用水源微污染處理技術、監測方法與水源地保護。
三、營養物質生物地球化學循環與面源污染控制研究
1、湖泊沉積物中磷形態微生物轉化機理與元素生物地球化學循環；湖泊底泥營養鹽釋放及穩定化的基礎理論和藍藻水華暴發的誘發因子研究；富營養化湖泊水生植被退化與恢復機理及資源化。
2、面源污染優先控制區的識別、控制運行機制與管理體系及綜合治理示范
3、經濟高速發展中小城鎮環境綜合治理，建立可持續發展的綜合生態系統。
四、高濃度難降解有機化工廢水處理與資源化的集成技術系統
1、高選擇性復合功能吸附樹脂的研制和系列不同孔徑、不同表面極性高交聯大孔吸附樹脂及超高交聯樹脂的開發。
2、高效生化水處理技術的研究：研制新型高效厭氧、好氧生物反應器，研究新型微生物載體的優選和固定化技術，高鹽份精細化工廢水末端治理的經濟、高效、穩定的微生物固定化技術。
3、樹脂吸附法與催化氧化、高效生化集成工藝技術的開發。
五、環境調控與區域環境管理
1、環境調控原理研究，及其在城鎮化進程與區域環境調控中的應用；
2、都市圈環境調控與生態城市規劃，小城鎮環境調控與生態城鎮規劃；
3、重點產業帶環境調控與區域協調發展，國家重大建設工程對區域環境安全影響的戰略評估。
本實驗室作為國內環境科學與工程技術的研究基地，充分發揮同濟大學和南京大學理工結合的優勢，瞄準國家目標、學科前沿和技術需求，致力于污染控制和資源化兩方面的應用基礎研究，為遏制我國環境污染和生態破壞、有限資源的合理利用和促進社會與經濟可持續發展提供理論和先導性技術。
實驗室現有在編固定人員36人。其中中科院院士1名，教授28人，優秀中青年人才5人。自2004年通過評估，實驗室的隊伍建設和結構更趨于合理，成長了一批年輕學術骨干，其中4位已在環境類影響因子最高的刊物E.S.T上發表論文，顯現了學術研究的創新意識和探索精神；實驗室還注重引進不同專業背景的青年學術骨干，促成和培育了新的生長點。
