江西中醫藥高等?？茖W校藥學系設有中藥學、中藥制藥技術、藥物制劑技術、藥物制劑技術（藥劑設備維護與管理方向）和醫藥營銷五個專業，在校生總人數達1100余人?，F設中藥、中藥制藥技術、藥物制劑技術、醫藥營銷等四個專業教研室，擁有一批科研、教學、實踐能力強的教師隊伍，在現有專任教師30人中，其中正高職稱3人、副高職稱5人、中級職稱9人，碩士研究生導師1人，碩士研究生17人，占專任教師總數的56.7%。同時聘請了26名來源生產一線、具有中高級技術職稱的外聘教師隊伍，其中高級技術職稱15人，為今后更好勝任崗位工作創造了條件。本系中藥專業是江西省特色專業，并且是江西省人才培養模式創新實驗區。
藥學系學生來自全國近13個省、直轄市、自治區。主要為醫藥相關企業培養從事藥品生產、藥品銷售、質量檢驗、藥品調劑、藥劑生產設備維護及管理等崗位的高素質技能型人才。
藥學系擁有比較完善的實驗實訓場地與設備?，F有8個教學實驗（訓）室共1870.68㎡、2所研究所（中藥研究所、建昌幫炮制技術研究所）及1家附屬藥廠，其中附屬藥廠（通過GMP認證）現有中藥飲片、滴眼液及外用洗劑生產線?？們r值921.8563萬元，其中包括高效液相色譜儀、氣相色譜儀及紫外可見分光光度計等一批先進分析儀器設備。同時不斷加大教學改革力度，主動適應社會需求，加大與省內外大中型醫藥企業的聯系，建立了江西匯仁集團、江西博雅生物制藥有限公司、江西博士達藥業有限公司、江西科倫藥業有限公司、撫州回音必集團、茅排野外中草藥實踐教學基地等81個校外實訓基地，能滿足學生認知實習、專業實習、畢業實習的需要，同時也為學生順利就業提供廣闊平臺。
近三年來，本系教師積極進行教科研工作，承擔國家自然科學基金課題1項、省級教學改革課題5項、校級教學改革課題4項，同時承擔省部級科研課題4項，地廳級及以上自然科學科研課題35項，橫向科研課題11項， 70％以上專任教師參與科學研究。編寫了一批具有校本特色的教材，如《中藥學概論》、《藥品生產質量管理規范概論》，近三年本系教師主編參編公開出版的教材共8本，自編輔助教學教材2本。同時撰寫并公開發表論文78篇，其中核心期刊26篇。
近三年計算機等級考試平均通過率達95％以上；英語等級考試平均通過率達75％以上。近兩年職業證書獲得率達到99％以上。根據學校就業率統計表明，本系畢業生具有良好的就業前景，2006年本系各專業畢業生初次簽約率為95.5％，年底累計就業率達98.5％；2007年本系畢業生初次就業率為86.7%，年底累計就業率達95.8％；2008年累計就業率達96％；2009年累計就業率達97%，2010年累計就業率達98.2%。
為及時收集人才市場對各專業人才培養的反饋意見，本系每年均進行市場調研。通過對2007屆畢業生進行了調查， 90.5%的畢業生認為在學校所學專業非常有用或是比較有用；認為培養模式及課程設置與藥業比較適應的占91.0%。而用人單位對畢業生整體工作表現評價優秀率高達70.3％，對畢業生工作各項能力評價較好的達90％以上。良好的社會聲譽也引起企業的極大關注，江西省知名制藥企業——江西博士達藥業有限公司在本校設立了“博士達藥業獎學金”，主要是獎勵本系各專業中品學兼優的學生，有效調動了他們學習的積極性與主動性。2010年，全國知名血液生物制品公司——江西博雅生物制藥有限公司在本校設立訂單培養班，即“博雅班” 。
為激勵家境貧困的學生更好地完成學業，本系學生還可申請國家獎學金及助困金，以緩解家庭經濟困難。
