東莞市清潔生產科技中心擁有5個實驗室：節能降耗實驗室、環保材料實驗室、環保技術實驗室、RoHS實驗室和清潔生產審核與能源檢測實驗室。
節能降耗實驗室
以分布式能源系統為研究對象，旨在研究分布式能源系統的技術方案，實現冷、熱、電聯產的能源利用最優模式，使能源利用效率達到80％以上。
主要實驗設備：柴油發電機、燃氣輪機、煙氣補燃型溴化鋰冷水機組、煙氣熱交熱器；太陽能空調實驗平臺有太陽能集熱器、除濕機組、空調機組換熱器、冷卻塔、高溫油泵及儲油箱。
負責人：楊曉西，博士，教授，博士生導師，東莞理工學院校長
環保材料實驗室
主要從事環保型新材料研究與開發，致力于環境工程方面的研究，為企業提供清潔生產的材料技術服務，為東莞培養掌握環境工程和材料學的應用性人才。
主要實驗設備：差示掃描量熱儀、熱重分析儀、動態力學分析儀、流變儀、電子萬能材料試驗機、單螺桿注塑機、雙螺桿擠出機、超級恒溫油浴。
負責人：劉治猛，教授，東莞市清潔生產科技中心主任。
環保技術實驗室
主要提供境保護提供綜合性技術以及清潔生產技術服務，包括常規的分析、檢測等。
主要實驗設備：有機氣體檢測儀（VOC）、20000立方米/小時流量風洞系統、400立方米/小時水流量循環測試系統、臭氧檢測儀、氣溶膠粉塵檢測儀（計重法）、電化學測試系統等。
負責人：范洪波，博士，教授，化學生物工程系主任兼黨總支書記
RoHS實驗室
對企業開展RoHS測試、認證等專項業務服務和相關法規政策的宣傳普及活動。
主要實驗設備：氣相色譜-質譜聯用儀、電感耦合等離子發射光譜（ICP）、傅立葉紅外光譜儀、X射線熒光光譜儀（XRF）、紫外可見光光度計。
負責人：徐勇軍，博士，副教授
是為對企業清潔生產審核和能源審核提供技術支持，提供相關能源檢測服務。
負責人：劉煜平，高級工程師
