蘇州工業園區職業技術學院機電工程系目前設有機電一體化技術、機電設備維修與管理、汽車運用技術三個專業。
其中“機電一體化技術”專業是蘇州工業園區職業技術學院最早設立的品牌專業之一,主要為學生提供從事機電一體化產品設計、生產、安裝調試與設備維護等方面的課程體系,以滿足現代制造業的用工需求;“機電設備維修與管理”主要為學生提供工廠基礎建設、機電設備運營和維護以及管理等方面的課程體系;“汽車運用技術”主要為學生提供以汽車及主要零部件基本構造為載體,以典型車型的維修保養、故障診斷及檢測、常見故障排除等技能的汽車診斷維修為主體的課程體系與核心技能,強化專業技能、滿足企業對高素質人才的要求。