黑龍江中醫藥大學中藥學實驗室于2000年經省教育廳正式批準為省高校重點實驗室，經過近年的建設，實驗室現已經形成了一支學歷、職稱與學緣結構都較為合理的研究隊伍和三個穩定發展的研究方向，并且在科研和人才培養等方面都取得了令人可喜的成績，極大的促進了中藥學學科的發展，更促進了黑龍江省醫藥經濟的發展和“北藥”開發工作的順利進行。
現有三個研究方向：中藥及復方藥效物質基礎研究、中藥及復方質量評價研究、中藥生物活性研究。
中藥學重點實驗室實行開放、競爭、流動、聯合的運行管理機制，走校企合作之路。實驗室主任為馬英麗教授，學術委員會主任為匡海學教授。目前實驗室擁有專兼職人員共32人，其中教授11名、副教授3名、講師1名、助教6名、高級實驗師2名、實驗師4名、高級工程師2名，主任藥師2名、高級工人1名。
中藥學重點實驗室現擁有分屬于三個研究方向的實驗室13個，總面積達1140平方米。
實驗室現有實驗設備和儀器總價值約為240萬元，其中包括學校實驗中心的共有設備如共聚焦顯微鏡、氣-質聯用色譜儀、毛細管分析系統、紅外光譜儀等，另外實驗室還自行擁有高效液相色譜儀、氣相色譜儀、薄層掃描儀、紫外分光光度計、大型旋轉蒸發儀等先進的儀器設備。
2002-2005年共承擔各級縱向科研項目36項、橫向課題4項，其中省部級以上項目24項（含863項目2項、國家自然科學基金2項、國家科技部攻關項目3項）。目前實驗室現可支配項目經費為679萬元（縱向334萬元，橫向345萬元）。
近三年來中藥學實驗室共鑒定教學、科研成果23項，榮獲各級科研獎勵20項和教學科研獎勵3項，科研獎勵包括國家級獎勵2項（包括國家科技進步二等獎1項）、?。ú浚┘壀剟?項（含正在公示的2005年兩項省政府科技進步獎）、廳局級獎勵10項，并獲得發明專利一項。
2002年-2005年共培養碩士研究生35名、博士研究生10名，目前在讀碩士研究生38人，博士研究生19人，并有在站博士后6人。
