1991年，時任齊齊哈爾第一機床廠教育處副處長曹勇安創辦了民辦黑龍江東亞大學。1993年黑龍江東亞大學合并工廠職工大學后，于1993年12月25日與工廠簽訂了分離合同，走上了一條“自主辦學，自擔費用、自我完善、自我發展”的民辦教育發展之路，開啟了全國“公轉民”辦學體制改革的先河。2001年3月，學校成為黑龍江首批高職院校之一， 校名為齊齊哈爾職業學院。2011年，學校經教育部批準升格為普通本科高校，更名為齊齊哈爾工程學院，成為齊齊哈爾市第一所市屬本科大學。2020年，學校順利通過國家本科教學工作合格評估。

學校始終堅持社會主義辦學方向，全面貫徹黨的教育方針，堅持公益性非營利辦學，堅持應用型人才培養，創造了影響中國民辦教育發展的兩個案例（“混合所有制辦學”和“院校委托管理”，后者被寫入《國家中長期教育改革和發展規劃綱要（2010-2020年）》），探索出了“政校企合作、產學研融合”辦學模式，凸顯了辦學優勢和辦學特色，促進了學校各項事業快速健康發展。目前，學校已發展成為以工學學科為主，管理學、醫學、藝術學等學科適度發展的全日制應用型本科院校。學校系全國唯一具有行政級別、事業單位編制的民辦高校。

學校總占地面積86.7萬平方米，建筑面積23萬余平方米；校內建有本科實驗場所114個；教學科研儀器設備總值6023.02萬元；館藏紙質圖書87.73萬冊，電子圖書37.4萬冊；室內、外運動場地總面積5萬余平方米；校園環境優美，文化氛圍濃厚。

學校以地方經濟社會發展需求為導向，不斷優化專業布局，設有機電工程系、建筑工程系、信息工程系、管理工程系、健康與護理系、馬克思主義學院、基礎部、學生發展中心、繼續教育部共9個二級教學單位；開設23個本科專業；現有全日制在校生8500余人。

“艱苦創校、課程立校、文化治校、精神興校、信仰傳校”， 學校始終堅持“以學生為中心”的教育理念，確立了“黨建領引、三全育人，黨政合力、齊抓落地”的工作方針，實施全員“生涯導師制”，創新實踐“三全育人”理念，設立教育質量獎。2015年10月，學校作為“基層創業教育孵化平臺”入選首個“全國大眾創業、萬眾創新活動周”，是唯一參展的地方高校。

學校堅持應用型本科教育研究，強化課程建設，堅持成果導向，探索人才培養新模式，提升專業與區域經濟社會發展的適配度，全面提高人才培養質量，機械設計制造及其自動化和車輛工程2個專業被確立為省級一流本科專業建設點，《思想道德與法治》《管理溝通》《土木工程材料》《成本與管理會計I》等4門課程被評為黑龍江省一流課程，獲批3個省級教學成果獎，建設建筑產業學院等6個校級產業學院，其中機床產業學院獲批省級首批現代產業學院。

校企合作、雙元育人。學校依托產業學院，以服務崗位需求和提高職業能力為導向，探索建立“護理類”“裝備制造類”和“建筑類”校外課堂，拓展育人時空，創新應用型人才培養模式 。

學校堅持需求導向的課程觀，開發了“四真三化”（FT）課程建設范式，為時下高校急難愁盼課程建設問題提供解決方案。該課改研究成果獲得2020年黑龍江省高等教育教學成果一等獎。 2021年至今，“四真三化”（FT）課程開發工作坊已舉辦40期，吸引全國200多所院校4000余名教師參與。與深圳公司研發課程開發智慧系統（課程通），研制了企業標準《課程開發指南》，《“四真三化”（FT）課程建設模式與實踐》課程被列入蘭州大學、廈門大學高等教育學研究生培養課程。

創校校長曹勇安教授以“潛心辦學，深耕課程，根植本土，面向未來，首創‘四真三化’（FT）課程開發模式”被評為“2022年度新時代中國杰出教育家”；“應用型課程開發創新工作室”榮獲“黑龍江省教科文衛體系統勞模和工匠人才創新工作室”稱號。

2015年1月，學校發起成立全國性的應用型課程建設聯盟；2016年4月，聯盟與教育部學校規劃建設發展中心共同成立課程建設研究院（現更名為課程建設協同創新中心），課程建設協同創新中心通過組織產教融合課改實驗、師說課改、應用型課程建設大課堂等活動，為推進全國應用型高校課程建設發揮了積極作用。

學校重視國際交流與合作，與美國、俄羅斯、韓國、日本等國家共十余所國外院校建立了友好合作關系，積極開展教學、科研等方面的交流合作，選派骨干教師赴美國訪學，聘請國外教授為學校學生授課。學校多次應邀出席國際會議交流課改經驗，已組織5批“應用型課程海外交流考察團”，赴美國、德國、英國、法國等國家有關高?？疾旖涣?。

學校堅持立德樹人，秉持“中而至庸，和而不同”校訓精神，努力培養志存高遠、人格健全，基礎扎實、特長明顯，勇于創新、善于實踐的應用性、職業型的創業者，積極探索應用型本科院校服務地方經濟社會發展的有效途徑，已為社會培養輸送了5萬余名畢業生，涌現出了以“大國工匠”——“華龍一號”主機手王剛為代表的一批優秀畢業生，畢業生畢業去向落實率名列全省高校前茅。