南京警察學院于2023年2月由南京森林警察學院更名而來。前身為1949年5月新生的南京市立農業職業學校。

學院辦學歷史可追溯到1941年南京特別市立第一職業中學。

1946年1月，南京市政府社會局將該校更名為南京市立第一職業學校。

1947年7月，南京市立第一職業學校原商農兩科分別獨立成立兩所學校，農科分出成立南京市立農業職業學校。

1948年，南京市立農業職業學校遷移至南京市燕子磯。

1949年4月南京解放，5月南京市軍管會接管了南京市立農業職業學校，11月校址遷至笆斗山。

1950年12月，學校更名為南京市農業學校。

1951年5月，華東軍政委員會將設在上海的華東農林干部訓練班與南京農業學校合并成立華東農林干部學校，由華東農林部接管。

1953年5月，江蘇省農林廳接管華東農林干校，并將第三部即中等技術學校與宜興農校的林科班合并，成立江蘇省南京農林技術學校。

1953年8月，經江蘇省人民政府批準，更名為江蘇省南京林業學校。

1954年10月，改屬林業部領導管理，更名為南京林業學校。

1994年9月，經中央編委批準，將南京林校改建為林業部南京人民警察學校。

1998年，林業部改為國家林業局，學校更名為國家林業局南京人民警察學校。

2000年3月，經教育部批準，在國家林業局南京人民警察學校的基礎上建立南京森林公安高等?？茖W校。

2010年3月，經教育部批準，在南京森林公安高等?？茖W?；A上建立南京森林警察學院。

2018年12月，由國家林業和草原局劃轉公安部領導管理。

2022年6月，公安部南京警犬研究所并入學院。

2023年2月,經教育部批準，南京森林警察學院更名為南京警察學院。