福建省固定床潔凈煤氣化工程技術研究中心

福建省中藥材草珊瑚規范化種植科技示范基地

三明市動漫創意產品設計與研發公共服務平臺

福建省高校重點實驗室：材料工程與結構加固重點實驗室

福建省高校工程技術研究中心：藥用植物開發利用工程研究中心

福建省高校工程技術研究中心：三明機械CAD工程研究中心

福建省高校人文社會科學研究基地：三明學院生態文化研究中心

復旦大學——三明學院天然藥物工程研究中心

福建三明汽車工程技術研究所

閩臺林業研究所

海峽動漫游研發與制作中心

三明學院客家文化研究所

三明學院計算機應用技術研究所

三明學院林產化學與涂料研究所

三明學院應用生物技術研究所

三明學院資源開發與規劃研究所

三明學院CAD/CAM技術研究所

三明學院生態文化與地方文化研究所

三明學院應用化學與化工研究所