安徽中醫藥大學前身為1952年創立的安徽省中醫進修班。1959年，安徽省人民政府批準成立安徽中醫學院。2011年，組建成立安徽省中醫藥科學院。2013年，教育部同意安徽中醫學院更名為安徽中醫藥大學。2014年，獲批安徽省地方特色高水平大學建設單位。2023年，列入安徽省“雙一流”創建重點高校。學校是國家中醫臨床研究基地、國家中醫藥國際合作基地，博士授權單位、碩士研究生推薦免試單位。
學?，F有少荃湖、梅山路、史河路、六安路四個校區，13個二級學院（含3所直屬附屬醫院），32個本科專業，全日制學生20242人（本科生16783人、博士生190人、碩士生3269人）。教職醫護員工4851人，其中副高以上職稱人員1175人。擁有國醫大師2人、國家杰青1人、岐黃學者1人、青年岐黃學者4人、全國名中醫4人、皖江學者1人、青年皖江學者3人、省特支計劃創新領軍人才10人、省杰青5人、省優青4人、國家名老中醫學術經驗項目指導教師56人，享受國務院特殊津貼27人、省政府特殊津貼12人，全國黃大年式教師團隊1個，國家教學名師1人，安徽省領軍人才團隊3個，省“115”產業創新團隊8個。2022年，聘任中國工程院院士、國醫大師王琦擔任我校榮譽校長。
學校現有6個國家級一流本科專業建設點，14門國家級一流本科課程，擁有3個一級學科及1個專業學位類別（領域）博士學位授權點，6個一級學科及4個專業學位類別（領域）碩士學位授權點，27個二級學科碩士學位授權點，3個博士后流動工作站。進入ESI全球排名前1%學科2個，安徽?、蝾?、Ⅲ類高峰學科各1個，安徽省高峰培育學科4個，安徽省重點學科13個，國家中醫藥管理局高水平中醫藥重點學科6個、重點學科17個。建有國家中醫區域醫療中心1個，國家區域中醫（?？疲┰\療中心3個，國家臨床重點?？?個，國家中醫藥管理局重點?？?3個。
學校以人才培養為第一要務，現有國家級教學團隊2個，省級教學團隊37個，國家級實驗教學示范中心2個，國家級中醫臨床教學培訓示范中心1個，國家級專業綜合改革試點項目1個，國家級卓越醫生（中醫）教育培養計劃2個，國家中醫藥高等學校教學名師2人。獲國家級教學成果一等獎1項、二等獎3項，省級教學成果特等獎8項、一等獎27項。學校獲國家級A類賽事一等獎8項，獲全國大中專學生志愿者暑期“三下鄉”社會實踐優秀單位、全國紅十字模范單位、全國“七彩假期”志愿服務示范單位、全國大學生年度人物提名獎等榮譽稱號。近5年畢業生平均就業率94%。
學校大力推進科技強校戰略，近5年，共承擔各級科研項目近2000項，其中國家級項目近200項；獲省部級以上科技獎勵54項，其中國家科學技術二等獎1項，省部級一等獎8項。擁有16個省級科技創新團隊，57個（含共建）省部級以上科技創新平臺。與龍頭企業建有50余個產學研合作基地。獲“全國科技特派員工作先進集體”“中醫藥科技管理工作先進集體”“推動中醫藥學術發展特別貢獻獎”等稱號和榮譽。
學校注重提升醫療服務水平，建有3所直屬附屬醫院、8所非直屬附屬醫院和國醫堂門診部。第一附屬醫院是全省最大的三級甲等綜合性中醫醫院；第二附屬醫院是全國首家也是規模最大的三級甲等針灸?？漆t院；2023年，獲建安徽省首個國家中醫區域醫療中心——上海中醫藥大學附屬曙光醫院安徽醫院。
學校積極響應國家“一帶一路”倡議，與20多個國家和地區的40多個醫療和教育機構建立了友好合作關系。在希臘設立安徽中醫藥大學雅典中醫藥中心。先后有10多個國家和地區的學員來校攻讀博士后、博士、碩士、學士學位以及參加中短期培訓。
目前，學校緊緊圍繞“雙一流”建設目標，以中醫藥學科為主體，統籌推進中醫藥學與理學、工學、管理學、經濟學、文學類學科的協同發展，構建完善交叉融合、相互支撐、協調發展、特色鮮明的學科專業體系，努力建成國內有實力、省內高水平、行業有影響的中醫藥特色鮮明的地方高水平大學，為建設現代化美好安徽、服務人民大眾健康和健康中國建設作出更大貢獻。
