學校的招生和就業工作受到社會各界的好評，多次被評為“江蘇省畢業生就業工作先進集體”，多次獲得江蘇省“文明單位”、“文明學校”榮譽稱號。

七十五年來，南京醫科大學為國家培養了一批又一批醫學人才，他們分布在全國各地的醫院、疾病控制中心、醫學研究機構和衛生行政部門，許多畢業生已成為國內外著名醫學專家和學者，為我國醫學教育和衛生事業的發展做出了重要貢獻！