1958年，中共浙江省委決定創辦一所高等林業院校，定名“天目林學院”。當年6月，以省林業廳為主，建德地委抽調黨政干部，一批知名教授和 留學歸國學者共同參與籌建。當時確定專業設置為林業、木材采伐與運輸機械化、木材機械加工和林產化學加工工藝專業。招生規模400名。

 1959年7月，省委、省人民委員會決定，溫州林學院與天目林學院合并。

 1960年2月，省委決定，浙江農學院、天目林學院、舟山水產學院合并，成立浙江農業大學。

 1962年2月，省委決定，天目林學院從浙江農業大學劃出，歸省教育廳領導，黨委工作歸省高校黨委領導。原屬省農科院領導的林科所劃歸省林業廳和天目林學院雙重領導。

 1966年9月，省人民委員會同意“天目林學院”改名為“浙江林學院”。  

 1970年7月，省革委會決定，浙江林學院與浙江農業大學合并。

 1978年4月，省革委會決定，浙江農業大學林學系改為浙江農業大學天目分校。

 1979年2月，國務院批準同意恢復浙江林學院。

 1981年12月，國務院批準浙江林學院為首批學士學位授予單位。

 1986年7月，根據省委、省政府指示，浙江林學院由省林業廳主管改由省教委主管。

 1997年11月，順利通過國家教委對我校本科教學合格評價。  

 1999年5月，學校制訂了《浙江林學院十年改革和發展綱要》。

 2000年7月，浙江省林業干部學校整體并入浙江林學院。

 2000年12月，浙江省發展計劃委員會批復同意浙江林學院擴建。2001年5月，新校區校園總體規劃方案通過評審。2001年6月6日，新校區一期工程開工建設。2002年10月8日，新校區一期工程竣工啟用。2003年7月6日，學校機關整體搬遷至東湖校區。

 2003年6月，學校出臺《浙江林學院學校定位與中長期發展規劃綱要(2003-2020)》。

 2003年9月，國務院學位委員會正式批準我校為碩士學位授予單位。

 2004年5月，召開中共浙江林學院第一次黨代會。

 2007年5月，優秀成績通過教育部本科教學工作水平評估。

 2008年10月，舉行浙江林學院建校50周年慶典。

 2010年3月，經教育部批準浙江林學院更名為浙江農林大學。6月6日，舉行浙江農林大學揭牌慶典。

 2010年7月，召開中共浙江農林大學第一次黨代會，提出“到2020年把學校初步建設成為國內知名的生態性創業型大學”的發展戰略目標。

 2010年12月，七屆二次教職工暨十屆二次工會會員代表大會審議通過《浙江農林大學中長期發展規劃綱要(2011-2020)》。

 2012年12月，獲批“竹資源與高效利用”服務國家特殊需求博士人才培養項目。

 2013年9月，諸暨校區建成啟用，天目學院整體搬遷。

 2013年9月，與塞爾維亞諾維薩德大學合作舉辦孔子學院。

 2014年2月，學校出臺《關于深化與完善校內管理體制改革的若干意見》。

 2014年7月，成為浙江省人民政府和國家林業局共建高校。

 2014年10月，獲批林學一級學科博士后科研流動站。

 2015年5月，《浙江農林大學章程》核準頒布。

 2015年11月，召開中共浙江農林大學第二次黨代會，提出“到2020年初步建成國內知名的生態性創業型大學”的戰略目標。

 2017年3月，獲批建設省部共建亞熱帶森林培育國家重點實驗室。

 2017年8月，入選浙江省重點建設高校。

 2018年5月，獲批博士學位授予單位。

 2018年10月，舉行浙江農林大學建校60周年慶典。