1931年11月， 中國共產黨在江西瑞金召開了第一次全國蘇維埃代表大會，成立了以毛澤東為主席的中央民主政府。為了適應革命戰爭的需要，經中央軍委批準，11月20日，中國共產黨創辦的第一所軍醫學校在江西瑞金誕生，賀誠任校長。

1932年2月，中國工農紅軍軍醫學校在江西雩都舉行軍醫期第一期開學典禮，毛澤東同志為學校制定了 '政治堅定，技術優良'的辦學方針。紅軍總司令朱德、總參謀長葉劍英到會并講話。

1932年10月，學校在設立軍醫期的基礎上，陸續開設了調劑班、看護班、衛生員班和衛生長班。中央軍委將中國工農紅軍軍醫學校更名為中國工農紅軍衛生學校。學校設立政治處、教育處和總務處。

1934年10月，為粉碎國民黨軍隊對中央革命根據地進行的第五次'圍剿'，中央紅軍開始戰略性大轉移，進行二萬五千里長征。中國工農紅軍衛生學校隨中央軍委，于10月中旬從瑞金出發。

1936年10月，中國工農紅軍衛生學校隨中央軍委到達陜北。

1940年，學校遷至延安后得到迅速發展，經毛澤東同志提議，學校更名為中國醫科大學。王斌繼續擔任學校校長。學校設校部。 學?！缎Ｕ隆分幸幎?，學校的性質是：'在中國共產黨的領導下，從事培養技術人才的學校'；學校的辦學目標是：'培養革命的技術優良的衛生干部，適應抗戰建國的需要，為民族解放與共產主義事業奮斗到底'；教育方針規定為：'培養政治堅定、思想正確、忠于職責、貫徹始終的衛生工作者'。學校對學制進行了調整，軍醫期為四年制，制藥班為三年制，調劑班為一年制。

1945年11月18日，根據黨中央建立鞏固東北革命根據地的指示精神，中國醫科大學從延安出發，挺進東北。

1946年7月，中國醫科大學到達黑龍江興山（現鶴崗市），合并了東北軍醫大學（前身為哈爾濱陸軍軍醫學校）。

1947年1月，中國醫科大學合并東北大學醫學院和原哈爾濱醫科大學一部分。學校設有一所設備完善的附屬醫院，醫院下轄4個所，每個所300 --400張床位。

1948年初，中國醫科大學設立4所分校，在龍井將吉林軍大分校設立為第一分校，以內科為主，校長任國祥；在哈爾濱建立了第二分校，以五官科為主，校長薛公綽；將通遼市遼東軍區醫專設立為第三分校，校長陳應謙；將平谷地區冀熱遼醫專設立為第四分校，校長劉紹九。

1948年10月，奉上級命令，學校派副校長李亭植率領部分干部、師生接收原長春大學醫學院，組成長春軍醫大學；第一、第二分校合并為現哈爾濱醫科大學，第三分校合并到總校；第四分校組建為現承德醫學院。

1948年11月，東北全境解放，中國醫科大學奉命進駐沈陽，根據東北行政委員會暨東北軍區司令部指示，先后合并了原國立沈陽醫學院和原私立遼寧醫科大學。

原國立沈陽醫學院前身為滿州醫科大學。1911年8月由日本國南滿鐵道株式會社于奉天（今沈陽）設立南滿醫學堂，1924年升格為滿洲醫學大學。該校設學部和專門部，學生以招收日本人為主，另招部分中國學生。該校具有一定學術水平，在當代中國和日本具有較大影響。1945年后，原滿洲醫學大學先后更名為中長鐵路醫學大學、鐵路醫學院、國立沈陽醫學院。該校共培養學生2543名，其中部分日本籍學生為日后中日兩國友好關系做了很多有益工作。中國籍學生大部分已成為我國醫療衛生和醫學教育事業的著名專家和學者。1948年11月并入中國醫科大學。

原私立遼寧醫科大學其前身為盛京醫學大學，于1892年由英國傳教士、醫學博士司督閣在奉天（今沈陽）開辦施醫院附設西醫學堂會，1912年建立奉天醫科大學，這是當時東北三省的第一所高等醫學院校。 其后學校更名為奉天醫學?？茖W校、私立遼寧醫科專門學校、盛京醫科大學、私立遼寧醫學院，該校以其教學嚴謹、注重人才質量而負盛名。該學校共培養學生531名，其中大部分學生已成為我國醫療衛生和醫學教育事業的著名專家和學者。1948年8月，遵照東北行政委員會的指示，該校并入中國醫科大學。

1949年5月，遵照東北軍區暨東北行政委員會命令，中國醫科大學由中國人民解放軍劃歸東北行政委員會領導。任命東北行政委員會衛生部部長王斌兼任校長，衛生部副部長白希清兼任副校長，陳應謙、闕森華任副校長，并成立校長辦公室。學校設基礎一院、基礎二院、內科學院、外科學院、牙科學院、公共衛生學院、婦嬰學院等8個學院。

1949年7月，東北藥學院并入中國醫科大學，為藥學院。學校按學科設學系，設有25個學系。

1950年3月1日，毛澤東主席、周恩來總理訪問蘇聯歸國途中路經沈陽，親臨學校視察，鼓勵全校師生辦好人民的醫科大學。

1950年．郭沫若來校參觀，親自題寫'中國醫科大學'校牌，并題詞。

1950年3月，中國醫科大學首次在全國招收具有高中文化程度的學生。學制為五年制。

1950年10月，朝鮮戰爭爆發， 根據上級指示，學校部分師生組成手術隊和擔架隊，并在黑龍江省北安縣成立北安醫院，承擔中國人民志愿軍抗美援朝傷員的救護工作。

1952年2月，學校成立細菌戰防御研究組，后改為東北防疫委員會研究組，副校長陳應謙兼任組長。學校吳執中、李佩琳、秦耀庭、景冠華等教授和有關技術人員參加了國際民主法律工作者協會調查團的技術鑒定工作，李佩琳教授等在國際科學委員會的報告書上莊嚴簽字。

1952年9月，學校制定《中國醫科大學校章》，確定了學校辦學宗旨和任務為：'培養具有高級文化水平，掌握現代科學技術的成就，體魄健全，全心全意為人民服務的高級衛生建設人才'。學校實行校長負責制的領導體制。調整專業設置和教學機構，撤消原8個學院，設醫學、兒科學、公共衛生3個專業，設附屬第一醫院、附屬第二醫院、附屬婦嬰醫院；設21個教研組；附設衛生學校。

1952年10月，根據國家教育部關于院系調整的決定，中國醫科大學藥學院改名為東北藥學院（現沈陽藥科大學），脫離中國醫科大學建制。

1954年8月，東北人民政府行政機構撤消，中國醫科大學劃歸國家衛生部領導。

1955年10月，中國醫科大學接受國家衛生部分配的研究生培養任務，使中國醫科大學成為我國最早設立研究生教育的學校之一，也中國醫科大學研究生教育的開端。

1955年7月，根據國家教育部關于院系調整的決定，中國醫科大學公共衛生學系并入哈爾濱醫科大學，學校設衛生教研組；哈爾濱醫科大學兒科學系并入中國醫科大學。

1955年8月，根據國家衛生部指示，學校建立醫療系、兒科學系。

1955年和1956年，根據國家需要，學校先后向新疆、內蒙等地十多所新建高等醫學院校成批輸送骨干技術人員和行政管理干部130余人。

1956年9月，根據國務院關于醫學院校調整的決定，中國醫科大學改名為沈陽醫學院。

1958年至1965年，學校先后向北京中醫學院、錦州醫學院、延邊醫學院、遼寧中醫學院等學校輸送骨干技術人員近百人。

1958年4月，學校成立基礎醫學部，并實行醫療系與附屬第一醫院、兒科系與附屬第二醫院院系合一的管理體系。

1959年4月，學校成立行政管理機構，設校長辦公室、人事處、教務處、醫院工作處、科學研究處、生產勞動處、總務處。

1959年9月，學校再次成立公共衛生學系，設7個教研組。

1960年5月，中國醫學科學院遼寧分院在學校建立7個研究所，即：勞動衛生研究所、實驗醫學研究所、婦幼衛生研究所、工業衛生研究所、衛生研究所、流行病研究所和外傷研究所，配備科研編制。

1961年9月，學校在全國首創醫學專業日語醫學班，學制為六年，年招收學生30名，培養能夠熟練掌握日語的高級醫學人才。

1962年，公共衛生學系重新并入哈爾濱醫科大學。

1976年，根據國家教育部指示，學校開始承擔培養我國留學生任務，來至8個國家的留學生入學。學校重建公共衛生學系。

1978年3月，經國家衛生部批準，學?；謴椭袊t科大學校名。3月1日，中國醫科大學召開大會，隆重慶祝學?；謴椭袊t科大學校名并掛校牌，國家有關部委和省、市領導親自到會表示祝賀。

1978年9月，中國醫科大學在全國首次設立六年制英語醫學班。

1979年，根據國家對醫學專業人才培養的需要，中國醫科大學增設法醫學專業和口腔學專業。

1979年5月，經國家衛生部批準，中國醫科大學建立了8個獨立專業性研究室，即：細胞生物研究室、針麻原理研究室、神經解剖研究室、腫瘤研究室、心血管病研究室、呼吸病研究室、聽力研究室、肝炎研究室，并配備科研編制。

1981年11月，國務院批準中國醫科大學首批博士、碩士學位授權學科、專業和導師，博士學位授權學科專業2個，碩士學位授權學科專業21個。

1982年3月，經國家衛生部批準，中國醫科大學成立學位評定委員會，根據國家關于學位授予有關規定，首次授予32人為醫學學位。

1984年，中國醫科大學試行在職研究生培養工作，并被國務院批準為第二批在職人員申請學位試點單位。1988年被例為質量免檢單位。

1985年5月，經國家衛生部批準，中國醫科大學正式建立法醫學系和口腔醫學系；籌備建立護