昆明醫科大學海源學院于2001年由昆明醫科大學聯合昆明富達實業集團創辦，2004年通過教育部首批審核，確認為獨立學院，是云南省唯一一所醫藥衛生類獨立學院。2013年通過省教育廳對獨立學院首批教學工作評估；2015年民辦本科院校辦學水平評估中獲A等；2023年在省屬民辦高校辦學情況評估中名列前茅。先后被評為云南省優秀普通高等學校、云南省民辦教育示范高校、云南省文明學校、云南省委組織部“兩新”組織黨建工作示范點、云南省大學生就業工作先進單位等。