新疆第二醫學院是一所以醫學類為主，理學、管理學等多學科協調發展的自治區直屬全日制普通本科高校。學院前身是新疆醫科大學厚博學院，創辦于2003年，為全日制普通本科獨立學院。2012年，經自治區人民政府批準，新疆醫科大學與克拉瑪依市采取合作辦學的方式共同建設厚博學院。2015年9月，厚博學院整體遷至克拉瑪依市。2021年1月，國家教育部批準厚博學院轉設為新疆第二醫學院。