學院是2001年4月由江西理工大學（原南方冶金學院）與江西虹聯實業公司聯合創辦的一所獨立學院，是江西省最早設立的8所獨立學院之一，也是首批經國家教育部確認的249所獨立學院之一。2002年2月、2004年5月先后更名為南方冶金學院應用科學學院和江西理工大學應用科學學院。