鄂爾多斯應用技術學院是在2008年開辦的內蒙古大學鄂爾多斯學院的基礎之上，于2015年4月整合內蒙古工業大學礦業學院、內蒙古醫科大學鄂爾多斯學院等辦學資源組建的全日制普通本科院校，是地方高校轉型發展過程中教育部批準成立的第一批以“應用技術”命名的本科院校。