首都醫科大學原名北京第二醫學院，創建于1956年8月30日。

 　　1985年8月22日更名為首都醫學院。

 　　1986年8月27日 ，確定首醫為市屬重點院校。

 　　1994年2月5日經教育部批準，更名為首都醫科大學。

 　　2001年2月12日北京聯合大學中醫藥學院、北京醫學高等?？茖W校和北京職工醫學院并入首都醫科大學。