2002年，青海大學向省教育廳上報《青海大學關于籌建二級學院的申請報告》，申請籌建二級學院。
2003年2月，省教育廳下發《關于青海大學籌建二級學院的批復》，根據文件有關規定，2003年2月青海大學與西部礦業有限責任公司雙方協商共同試辦二級學院，并簽訂了合作協議書。
2004年2月，教育部下發《關于對青海省普通高等學校舉辦的獨立學院的確認通知》。
2004年3月，省教育廳下發《關于青海大學昆侖學院予以確認的通知》。我院成為我省唯一一所普通本科獨立學院。
2004年7月，學院開始招生，在青海大學主校區辦學。
2009年9月，經青海大學本科教學資源整合，正式搬遷至現校區，形成兩校區辦學格局。
