2013年，阿克蘇地委、行署著眼經濟發展和長治久安總目標，積極與新疆大學合作洽談謀劃在地區建一所大學，并達成了規劃建設協議。2014年經自治區人民政府批準，同意將隸屬于新疆大學管理的科學技術學院（該學院成立于2002年，為民辦獨立三本院校）逐步搬遷至阿克蘇。2015年，阿克蘇地委、行署籌措資金15億余元，以時不我待的緊迫感于當年3月開工建設科技學院阿克蘇校區，并實現了當年開工、當年建成、當年招生，創造了高等教育史上的新疆效率、阿克蘇速度。至2017年，新疆大學科學技術學院已整體搬遷至阿克蘇，并于同年開始籌備轉設工作，在自治區人民政府和教育廳的大力支持下，于2019年6月10日經教育部批準，新疆大學科學技術學院成功轉設為新疆理工學院（《關于同意新疆大學科學技術學院轉設新疆理工學院的函》（教發函〔2019〕51號））。新疆理工學院的成功轉設，是阿克蘇歷史上具有里程碑意義的大喜事，填補了阿克蘇高等教育的空白，補齊了新疆理工教育的短板，鑄就了培養區域性高素質人才的搖籃。